Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000165035 #22
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000165035.a #22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	291												ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000172088	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159568 #36
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	259					ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b #11	ENSGT00940000164716.A #13	ENSGT00940000159824	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000156068.j	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	258					ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b #11	ENSGT00940000164716.A #13	ENSGT00940000159824	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00550000075136 #26	ENSGT00440000037505.b #27	ENSGT00940000155470.a #28	ENSGT00390000006788.a.a #29	ENSGT00940000154894.a	ENSGT00940000165596.d	ENSGT00940000160491.d.b #30	ENSGT00510000047420 #31	ENSGT00940000160376 #32	ENSGT00390000017869 #33
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154808.a.b.j.a	ENSGT00940000153147.a.b	ENSGT00940000155070.a.b.a	ENSGT00940000162301 #7	ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b.k #11	ENSGT00940000164716.A #13	ENSGT00940000157037.a.d #15	ENSGT00990000209953 #17	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00550000075136 #26	ENSGT00440000037505.b #27	ENSGT00940000155470.a #28	ENSGT00390000006788.a.a #29	ENSGT00940000154894.a	ENSGT00940000160491.d.b.b ##30	ENSGT00940000165596.d	ENSGT00940000160491.d.b.a #30	ENSGT00510000047420 #31	ENSGT00940000160376 #32	ENSGT00390000017869 #33	ENSGT00940000159784 #34
Zebrafish	MODERN SPECIES	5	CHRM1 (ENSDARG00000037292) #7	BNIP1 (ENSDARG00000078259) #8	nkx2.5 (ENSDARG00000018004) #9	stc2a (ENSDARG00000056680) #10	cpeb4a (ENSDARG00000056691) #11	ENSDARG00000105348 #12	msx2a (ENSDARG00000104651) #13	ENSDARG00000110728 #14	ENSDARG00000071640 #15	ENSDARG00000105377 #16	il4 (ENSDARG00000087909) #17	kif3a (ENSDARG00000087538) #18	ENSDARG00000101178 #19	kctd16a (ENSDARG00000004648) #20	nr3c1 (ENSDARG00000025032) #21	fgf1a (ENSDARG00000017542) #22	ndfip1 (ENSDARG00000013979) #23	gnpda1 (ENSDARG00000037307) #24	hspa4b (ENSDARG00000018989) #25	MARS2 (ENSDARG00000009218) #26	med12 (ENSDARG00000103953) #27	ENSDARG00000076547 #28	ENOX2 (ENSDARG00000078942) #29	ENSDARG00000074582 #30	smyd5 (ENSDARG00000071669) #31	ENSDARG00000056830 #32	nudt22 (ENSDARG00000071671) #33	gdf9 (ENSDARG00000003229) #34	ENSDARG00000079125 #35	atp7a (ENSDARG00000003699) #36	ENSDARG00000037738 #37
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1086																ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.i #23
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	509	ENSSGRG00000043831	ENSSGRG00000043832	si:dkey-6i22.5 (ENSSGRG00000043833)	gatad1 (ENSSGRG00000043834)	ccng1 (ENSSGRG00000043843)	gabra6a (ENSSGRG00000043844)	gabrb2a (ENSSGRG00000043845)	ENSSGRG00000043917	ENSSGRG00000043918	ENSSGRG00000043919 ##37	atp7a (ENSSGRG00000043921) #36	ENSSGRG00000044319 #35	gdf9 (ENSSGRG00000044322) #34	nudt22 (ENSSGRG00000044326) #33	ENSSGRG00000044329 #32	fgf1a (ENSSGRG00000044335) #22	ndfip1 (ENSSGRG00000044336) #23	gnpda1 (ENSSGRG00000044337) #24	hspa4b (ENSSGRG00000044427) #25	med12 (ENSSGRG00000046263) #27	ENSSGRG00000047576 #28	ENOX2 (ENSSGRG00000047727) #29	ENSSGRG00000047728	SLC4A11 (ENSSGRG00000047730)	ENSSGRG00000047731 #30	nr3c1 (ENSSGRG00000047732) #21	kctd16a (ENSSGRG00000047733) #20
Goldfish	MODERN SPECIES	5	CXCL14 (ENSCARG00000007898)	fam13b (ENSCARG00000007927)	hnrnpa0a (ENSCARG00000008003)	dpf2l (ENSCARG00000008017)	BNIP1 (ENSCARG00000008054) #8	nkx2.5 (ENSCARG00000008074) #9	stc2a (ENSCARG00000008081) #10	cpeb4a (ENSCARG00000008113) #11	msx2a (ENSCARG00000008376) #13	ENSCARG00000008381 #15	il4 (ENSCARG00000008385) #17	kif3a (ENSCARG00000008420) #18	ENSCARG00000008797	kctd16a (ENSCARG00000008801) #20	nr3c1 (ENSCARG00000008819) #21	fgf1a (ENSCARG00000008975) #22	ndfip1 (ENSCARG00000008984) #23	gnpda1 (ENSCARG00000008994) #24	hspa4b (ENSCARG00000009046) #25	ENSCARG00000009174	ENSCARG00000009216 #28	ENOX2 (ENSCARG00000009253) #29	SLC4A11 (ENSCARG00000009333)	ENSCARG00000009424	ENSCARG00000009434 #30	smyd5 (ENSCARG00000009444) #31	ENSCARG00000009459	ENSCARG00000009467 #32	nudt22 (ENSCARG00000009482) #33	gdf9 (ENSCARG00000009496) #34	atp7a (ENSCARG00000009632) #36
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Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.g	ENSGT00940000164356.b	ENSGT00940000164356.a	ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b #11	ENSGT00940000164716.A #13	ENSGT00940000159824	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000158460	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00550000075136 #26	ENSGT00440000037505.b #27	ENSGT00940000155470.a #28	ENSGT00390000006788.a.a #29	ENSGT00940000154894.a	ENSGT00940000165596.d	ENSGT00940000160491.d.b #30	ENSGT00510000047420 #31	ENSGT00940000160376 #32	ENSGT00390000017869 #33	ENSGT00940000153596.A	ENSGT00940000164078.a.a	ENSGT00940000157138.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00940000164577.b	ENSGT00940000166254.a	ENSGT00940000178677	ENSGT00950000183177.a.a.a.a.g	ENSGT00940000164356.a.g	ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b #11	ENSGT00940000159824	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00550000075136 #26	ENSGT00440000037505.b #27	ENSGT00940000155470.a #28	ENSGT00390000006788.a.a #29
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	95	arl3l2 (ENSPNAG00000010083)	rgs14a (ENSPNAG00000010119)	SLC34A1 (ENSPNAG00000010150)	ENSPNAG00000010184	BNIP1 (ENSPNAG00000010213) #8	nkx2.5 (ENSPNAG00000010223) #9	stc2a (ENSPNAG00000010234) #10	cpeb4a (ENSPNAG00000010337) #11	MSX2 (ENSPNAG00000010350)	DRD1 (ENSPNAG00000010364)	kif3a (ENSPNAG00000010505) #18	ENSPNAG00000010543 #19	ENSPNAG00000001406	kctd16a (ENSPNAG00000010562) #20	nr3c1 (ENSPNAG00000010593) #21	fgf1a (ENSPNAG00000010607) #22	ndfip1 (ENSPNAG00000010636) #23	gnpda1 (ENSPNAG00000001421) #24	hspa4b (ENSPNAG00000010764) #25	SLC4A11 (ENSPNAG00000010831)	ENSPNAG00000010851	ENSPNAG00000010866 #30	smyd5 (ENSPNAG00000001464) #31	ENSPNAG00000001472 #32	nudt22 (ENSPNAG00000010939) #33	exosc3 (ENSPNAG00000010975)	cdx1a (ENSPNAG00000010979)	pdgfrb (ENSPNAG00000011017)	csf1ra (ENSPNAG00000011099)	HMGXB3 (ENSPNAG00000011123)	ENSPNAG00000005736
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	23	rgs14a (ENSAMXG00000034408)	ENSAMXG00000044001	SLC34A1 (ENSAMXG00000018474)	adra2db (ENSAMXG00000025107)	BNIP1 (ENSAMXG00000038546) #8	nkx2.5 (ENSAMXG00000030019) #9	stc2a (ENSAMXG00000037057) #10	ENSAMXG00000043304	cpeb4a (ENSAMXG00000030295) #11	ENSAMXG00000038880	DRD1 (ENSAMXG00000025106)	kif3a (ENSAMXG00000011654) #18	ENSAMXG00000041131 #19	kctd16a (ENSAMXG00000030164) #20	nr3c1 (ENSAMXG00000011646) #21	fgf1a (ENSAMXG00000035950) #22	ndfip1 (ENSAMXG00000011640) #23	gnpda1 (ENSAMXG00000011634) #24	hspa4b (ENSAMXG00000011616) #25	MARS2 (ENSAMXG00000011610) #26	med12 (ENSAMXG00000011603) #27	ENSAMXG00000011595 #28	ENOX2 (ENSAMXG00000011589) #29	ENSAMXG00000030265	SPOCK1 (ENSAMXG00000015732)	etf1a (ENSAMXG00000037774)	fbxw11a (ENSAMXG00000015774)	ENSAMXG00000029171	fgf18a (ENSAMXG00000034427)	ENSAMXG00000015803	ENSAMXG00000024854
Channel catfish	MODERN SPECIES	5	ENSIPUG00000010492	rgs14a (ENSIPUG00000010477)	ENSIPUG00000010459	SLC34A1 (ENSIPUG00000010376)	ENSIPUG00000010353	bnip1 (ENSIPUG00000010328) #8	nkx2-5 (ENSIPUG00000010324) #9	STC2 (ENSIPUG00000010313) #10	cpeb4a (ENSIPUG00000010268) #11	MSX2 (ENSIPUG00000010256)	DRD1 (ENSIPUG00000010246)	KIF3A (ENSIPUG00000010161) #18	ENSIPUG00000010109 #19	kctd16a (ENSIPUG00000010102) #20	nr3c1 (ENSIPUG00000010081) #21	fgf1a (ENSIPUG00000010050) #22	ndfip1l (ENSIPUG00000010007) #23	gnpda1 (ENSIPUG00000009918) #24	hspa4b (ENSIPUG00000009875) #25	MARS2 (ENSIPUG00000009852) #26	med12 (ENSIPUG00000009787) #27	ENSIPUG00000009667 #28	ENOX2 (ENSIPUG00000009623) #29	ENSIPUG00000009609	ENSIPUG00000009583 #30	smyd5 (ENSIPUG00000009532) #31	ENSIPUG00000009518 #32	nudt22 (ENSIPUG00000009503) #33	EXOSC3 (ENSIPUG00000009488)	cdx1 (ENSIPUG00000009477)	pdgfrb (ENSIPUG00000009456)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	222						ENSGT00390000014412.l #8	ENSGT00940000158996 #9	ENSGT00390000005989.a.b.b #10	ENSGT00940000154998.a.b #11	ENSGT00940000164716.A #13	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000156068.j	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a
Atlantic herring	MODERN SPECIES	12	ENSCHAG00000022699	ENSCHAG00000022688	pola2 (ENSCHAG00000022279)	dpf2l (ENSCHAG00000022183)	ENSCHAG00000022166	BNIP1 (ENSCHAG00000022159) #8	nkx2.5 (ENSCHAG00000022155) #9	STC2 (ENSCHAG00000022150) #10	cpeb4a (ENSCHAG00000021905) #11	msx2a (ENSCHAG00000021897) #13	ENSCHAG00000021879	DRD1 (ENSCHAG00000021860)	kif3a (ENSCHAG00000021430) #18	kctd16a (ENSCHAG00000021424) #20	nr3c1 (ENSCHAG00000021359) #21	fgf1a (ENSCHAG00000021169) #22	hspa4b (ENSCHAG00000015977) #25	uqcrq (ENSCHAG00000015813)	gdf9 (ENSCHAG00000015806) #34	ENSCHAG00000015793 #35	atp7a (ENSCHAG00000012463) #36	ENSCHAG00000012405 #37	ENSCHAG00000012297	gabrb2a (ENSCHAG00000012066)	ENSCHAG00000012048	ENSCHAG00000012027	WDR1 (ENSCHAG00000011964)	ENSCHAG00000011572	rnf20 (ENSCHAG00000010471)	ENSCHAG00000010434	ENSCHAG00000010394
Denticle herring	MODERN SPECIES	9	ENSDCDG00000022127	ENSDCDG00000022140	ENSDCDG00000022142	ENSDCDG00000022145	WNT8A (ENSDCDG00000022148)	BNIP1 (ENSDCDG00000022176) #8	nkx2.5 (ENSDCDG00000022178) #9	STC2 (ENSDCDG00000022179) ##10	cpeb4a (ENSDCDG00000022186) #11	msx2a (ENSDCDG00000022191) #13	DRD1 (ENSDCDG00000022194)	kif3a (ENSDCDG00000022217) #18	ENSDCDG00000022817	kctd16a (ENSDCDG00000022819) #20	nr3c1 (ENSDCDG00000022825) #21	fgf1a (ENSDCDG00000022828) #22	gnpda1 (ENSDCDG00000022832) #24	hspa4b (ENSDCDG00000022882) #25	uqcrq (ENSDCDG00000023405)	ENSDCDG00000023407 ##35	atp7a (ENSDCDG00000023427) #36	ENSDCDG00000025781 #37	ATP10B (ENSDCDG00000025857)	gabrb2a (ENSDCDG00000025943)	gabra6a (ENSDCDG00000025980)	nudcd2 (ENSDCDG00000025985)	ccng1 (ENSDCDG00000025989)	septin8b (ENSDCDG00000026013)	sfxn1 (ENSDCDG00000027201)	ppp2caa (ENSDCDG00000027230)	si:ch1073-44g3.1 (ENSDCDG00000027232)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	25												ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000156281	ENSGT00940000159746	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00940000172088	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.kb	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000155763.b	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	292	si:ch211-153b23.4 (ENSLBEG00000026309)	ENSLBEG00000026324	irg1l (ENSLBEG00000026345)	glod5 (ENSLBEG00000026362)	RLIM (ENSLBEG00000026378)	NEXMIF (ENSLBEG00000026398)	abcb7 (ENSLBEG00000026411)	uprt (ENSLBEG00000026431)	zdhhc15b (ENSLBEG00000026448)	fgf16 (ENSLBEG00000026470)	atrx (ENSLBEG00000026519)	kif3a (ENSLBEG00000026602) #18	ENSLBEG00000026653	kctd16a (ENSLBEG00000026659) #20	nr3c1 (ENSLBEG00000026667) #21	fgf1a (ENSLBEG00000026702) #22	NDFIP1 (ENSLBEG00000026749) #23	gnpda1 (ENSLBEG00000026769) #24	hspa4b (ENSLBEG00000026794) #25	uqcrq (ENSLBEG00000026868)	gdf9 (ENSLBEG00000026878) #34	ENSLBEG00000026884 #35	septin8b (ENSLBEG00000026898)	ccng1 (ENSLBEG00000026921)	nudcd2 (ENSLBEG00000026933)	gabra6a (ENSLBEG00000026941)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
European seabass	MODERN SPECIES	12	ENSDLAG00005009090	irg1l (ENSDLAG00005009077)	RLIM (ENSDLAG00005026581)	ENSDLAG00005030037	abcb7 (ENSDLAG00005007497)	UPRT (ENSDLAG00005029932)	zdhhc15b (ENSDLAG00005007210)	fgf16 (ENSDLAG00005007185)	atrx (ENSDLAG00005005529)	ENSDLAG00005005498	kif3a (ENSDLAG00005005336) #18	ENSDLAG00005005327	kctd16a (ENSDLAG00005005323) #20	nr3c1 (ENSDLAG00005005166) #21	ENSDLAG00005005071 #23	fgf1a (ENSDLAG00005034772) #22	gnpda1 (ENSDLAG00005005010) #24	hspa4b (ENSDLAG00005001647) #25	ENSDLAG00005001454 #35	ENSDLAG00005001304	nudcd2 (ENSDLAG00005001225)	gabra6a (ENSDLAG00005018177)	gabrb2a (ENSDLAG00005018021)	ENSDLAG00005017903	ENSDLAG00005026618 #37	atp7a (ENSDLAG00005017297) #36	sfxn1 (ENSDLAG00005017244)	ppp2caa (ENSDLAG00005026994)	si:ch1073-44g3.1 (ENSDLAG00005017178)	ENSDLAG00005016744	SLU7 (ENSDLAG00005016524)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES		ENSLCRG00005011619	irg1l (ENSLCRG00005011616)	glod5 (ENSLCRG00005011615)	RLIM (ENSLCRG00005011614)	NEXMIF (ENSLCRG00005011613)	abcb7 (ENSLCRG00005010171)	zdhhc15b (ENSLCRG00005010107)	uprt (ENSLCRG00005010100)	fgf16 (ENSLCRG00005010099)	atrx (ENSLCRG00005007019)	ENSLCRG00005006975	kif3a (ENSLCRG00005006801) #18	ENSLCRG00005006795	kctd16a (ENSLCRG00005006794) #20	nr3c1 (ENSLCRG00005006669) #21	fgf1a (ENSLCRG00005006666) #22	NDFIP1 (ENSLCRG00005006665) #23	gnpda1 (ENSLCRG00005006664) #24	hspa4b (ENSLCRG00005000419) #25	uqcrq (ENSLCRG00005018037)	gdf9 (ENSLCRG00005018036) #34	ENSLCRG00005018034 #35	septin8b (ENSLCRG00005016934)	ccng1 (ENSLCRG00005016925)	nudcd2 (ENSLCRG00005016924)	gabra6a (ENSLCRG00005016921)	gabrb2a (ENSLCRG00005016896)	ATP10B (ENSLCRG00005016882)	ENSLCRG00005016875 #37	atp7a (ENSLCRG00005016843) #36	sfxn1 (ENSLCRG00005016825)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	9	ENSSAUG00010015031	irg1l (ENSSAUG00010015033)	glod5 (ENSSAUG00010015035)	RLIM (ENSSAUG00010015036)	NEXMIF (ENSSAUG00010015037)	abcb7 (ENSSAUG00010015066)	uprt (ENSSAUG00010016912)	zdhhc15b (ENSSAUG00010016921)	fgf16 (ENSSAUG00010016926)	atrx (ENSSAUG00010016937)	ENSSAUG00010017650	kif3a (ENSSAUG00010017659) #18	ENSSAUG00010018155 #19	kctd16a (ENSSAUG00010018158) #20	nr3c1 (ENSSAUG00010018162) #21	fgf1a (ENSSAUG00010018247) #22	NDFIP1 (ENSSAUG00010018254) #23	gnpda1 (ENSSAUG00010018262) #24	hspa4b (ENSSAUG00010018272) #25	UQCRQ (ENSSAUG00010018590)	gdf9 (ENSSAUG00010018591) #34	ENSSAUG00010002572 #35	septin8b (ENSSAUG00010002596)	ccng1 (ENSSAUG00010002646)	nudcd2 (ENSSAUG00010002658)	gabra6a (ENSSAUG00010002674)	gabrb2a (ENSSAUG00010002699)	ATP10B (ENSSAUG00010002957)	ENSSAUG00010004536 #37	atp7a (ENSSAUG00010004556) #36	sfxn1 (ENSSAUG00010004688)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Pike perch	MODERN SPECIES	36	si:ch211-153b23.5 (ENSSLUG00000019340)	si:ch211-153b23.4 (ENSSLUG00000019345)	irg1l (ENSSLUG00000019357)	glod5 (ENSSLUG00000019362)	RLIM (ENSSLUG00000019366)	abcb7 (ENSSLUG00000019408)	uprt (ENSSLUG00000020403)	zdhhc15b (ENSSLUG00000020424)	fgf16 (ENSSLUG00000020430)	atrx (ENSSLUG00000020556)	kif3a (ENSSLUG00000022215) #18	ENSSLUG00000022249	ENSSLUG00000022250	kctd16a (ENSSLUG00000022251) #20	nr3c1 (ENSSLUG00000022260) #21	fgf1a (ENSSLUG00000001529) #22	NDFIP1 (ENSSLUG00000001572) #23	gnpda1 (ENSSLUG00000001587) #24	hspa4b (ENSSLUG00000001918) #25	uqcrq (ENSSLUG00000002657)	gdf9 (ENSSLUG00000002659) #34	septin8b (ENSSLUG00000002707)	ENSSLUG00000004342 #35	ccng1 (ENSSLUG00000004344)	nudcd2 (ENSSLUG00000004353)	gabra6a (ENSSLUG00000004367)	gabrb2a (ENSSLUG00000004401)	ATP10B (ENSSLUG00000004497)	ENSSLUG00000004658 #37	atp7a (ENSSLUG00000004780) #36	sfxn1 (ENSSLUG00000006818)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.5 (ENSCGOG00000013011)	ENSCGOG00000013005	irg1l (ENSCGOG00000013000)	glod5 (ENSCGOG00000012993)	RLIM (ENSCGOG00000012990)	NEXMIF (ENSCGOG00000012988)	abcb7 (ENSCGOG00000012317)	uprt (ENSCGOG00000012269)	zdhhc15b (ENSCGOG00000012232)	fgf16 (ENSCGOG00000012224)	atrx (ENSCGOG00000011030)	kif3a (ENSCGOG00000009757) #18	ENSCGOG00000009662	kctd16a (ENSCGOG00000009660) #20	nr3c1 (ENSCGOG00000009555) #21	fgf1a (ENSCGOG00000009551) #22	NDFIP1 (ENSCGOG00000009548) #23	gnpda1 (ENSCGOG00000009491) #24	hspa4b (ENSCGOG00000007963) #25	uqcrq (ENSCGOG00000007938)	gdf9 (ENSCGOG00000007936) #34	ENSCGOG00000007935 #35	septin8b (ENSCGOG00000005538)	nudcd2 (ENSCGOG00000005391)	ccng1 (ENSCGOG00000005424)	gabra6a (ENSCGOG00000005387)	gabrb2a (ENSCGOG00000005240)	ENSCGOG00000005226	ENSCGOG00000005221 #37	atp7a (ENSCGOG00000003847) #36	sfxn1 (ENSCGOG00000003776)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.4 (ENSCLMG00005018931)	ENSCLMG00005018932	irg1l (ENSCLMG00005018933)	glod5 (ENSCLMG00005018934)	RLIM (ENSCLMG00005018935)	NEXMIF (ENSCLMG00005018937)	abcb7 (ENSCLMG00005018953)	uprt (ENSCLMG00005020068)	zdhhc15b (ENSCLMG00005020076)	fgf16 (ENSCLMG00005020121)	atrx (ENSCLMG00005020135)	kif3a (ENSCLMG00005020731) #18	SH3RF2 (ENSCLMG00005020757)	kctd16a (ENSCLMG00005020759) #20	nr3c1 (ENSCLMG00005020761) #21	fgf1a (ENSCLMG00005020763) #22	NDFIP1 (ENSCLMG00005020782) #23	gnpda1 (ENSCLMG00005020783) #24	hspa4b (ENSCLMG00005020790) #25	gdf9 (ENSCLMG00005021126) #34	ENSCLMG00005021127 #35	septin8b (ENSCLMG00005021131)	ccng1 (ENSCLMG00005021134)	nudcd2 (ENSCLMG00005021135)	gabra6a (ENSCLMG00005021137)	gabrb2a (ENSCLMG00005021142)	ATP10B (ENSCLMG00005021174)	ENSCLMG00005021176 #37	atp7a (ENSCLMG00005001792) #36	sfxn1 (ENSCLMG00005007551)	ppp2caa (ENSCLMG00005007554)
Stickleback	MODERN SPECIES	3	irg1l (ENSGACG00000018250)	si:ch211-153b23.5 (ENSGACG00000018249)	ENSGACG00000018246	irg1l (ENSGACG00000018245)	RLIM (ENSGACG00000018243)	NEXMIF (ENSGACG00000018242)	abcb7 (ENSGACG00000018231)	uprt (ENSGACG00000018229)	zdhhc15b (ENSGACG00000018224)	fgf16 (ENSGACG00000018221)	atrx (ENSGACG00000018218)	kif3a (ENSGACG00000018214) #18	ENSGACG00000018213 #19	kctd16a (ENSGACG00000018211) #20	nr3c1 (ENSGACG00000018209) #21	fgf1a (ENSGACG00000018207) #22	gnpda1 (ENSGACG00000018200) #24	hspa4b (ENSGACG00000018188) #25	uqcrq (ENSGACG00000018187)	gdf9 (ENSGACG00000018186) #34	septin8b (ENSGACG00000018181)	ccng1 (ENSGACG00000018175)	nudcd2 (ENSGACG00000018171)	gabra6a (ENSGACG00000018169)	gabrb2a (ENSGACG00000018167)	ENSGACG00000018164 #37	atp7a (ENSGACG00000018161) #36	sfxn1 (ENSGACG00000018159)	ppp2caa (ENSGACG00000018152)	atp5po (ENSGACG00000018149)	si:ch1073-44g3.1 (ENSGACG00000018148)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000001775.A	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Fugu	MODERN SPECIES	5	si:ch211-153b23.4 (ENSTRUG00000031149)	glod5 (ENSTRUG00000023963)	ENSTRUG00000029524	glod5 (ENSTRUG00000009099)	RLIM (ENSTRUG00000020047)	NEXMIF (ENSTRUG00000009017)	abcb7 (ENSTRUG00000008824)	uprt (ENSTRUG00000021064)	zdhhc15b (ENSTRUG00000008545)	fgf16 (ENSTRUG00000022728)	atrx (ENSTRUG00000022330)	kif3a (ENSTRUG00000007874) #18	ENSTRUG00000024067	kctd16a (ENSTRUG00000007820) #20	nr3c1 (ENSTRUG00000007443) #21	fgf1a (ENSTRUG00000007357) #22	NDFIP1 (ENSTRUG00000007238) #23	hspa4b (ENSTRUG00000006546) #25	ENSTRUG00000021050 #34	septin8b (ENSTRUG00000006162)	ccng1 (ENSTRUG00000027749)	nudcd2 (ENSTRUG00000032433)	gabra6a (ENSTRUG00000005703)	gabrb2a (ENSTRUG00000005507)	ATP10B (ENSTRUG00000004741)	ENSTRUG00000004586 #37	atp7a (ENSTRUG00000003659) #36	sfxn1 (ENSTRUG00000002626)	atp5po (ENSTRUG00000002128)	si:ch1073-44g3.1 (ENSTRUG00000026079)	ENSTRUG00000001818
Tetraodon	MODERN SPECIES		si:ch211-153b23.5 (ENSTNIG00000008959)	si:ch211-153b23.4 (ENSTNIG00000008958)	glod5 (ENSTNIG00000008957)	RLIM (ENSTNIG00000008956)	NEXMIF (ENSTNIG00000000495)	abcb7 (ENSTNIG00000008955)	uprt (ENSTNIG00000008954)	zdhhc15b (ENSTNIG00000008953)	fgf16 (ENSTNIG00000008952)	atrx (ENSTNIG00000008951)	kif3a (ENSTNIG00000008950) #18	kif3a (ENSTNIG00000008949) #18	ENSTNIG00000008948	kctd16a (ENSTNIG00000008947) #20	nr3c1 (ENSTNIG00000008946) #21	fgf1a (ENSTNIG00000008945) #22	NDFIP1 (ENSTNIG00000008944) #23	gnpda1 (ENSTNIG00000008943) #24	hspa4b (ENSTNIG00000008942) #25	uqcrq (ENSTNIG00000002046)	gdf9 (ENSTNIG00000008941) #34	ENSTNIG00000008940 #35	septin8b (ENSTNIG00000008939)	ccng1 (ENSTNIG00000008938)	nudcd2 (ENSTNIG00000008937)	gabra6a (ENSTNIG00000008936)	gabrb2a (ENSTNIG00000008935)	ENSTNIG00000008934	ENSTNIG00000008933 #37	atp7a (ENSTNIG00000008932) #36	sfxn1 (ENSTNIG00000008931)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000155763.b	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.5 (ENSMAMG00000009307)	si:ch211-153b23.4 (ENSMAMG00000028589)	irg1l (ENSMAMG00000009264)	glod5 (ENSMAMG00000028555)	RLIM (ENSMAMG00000009251)	NEXMIF (ENSMAMG00000009248)	abcb7 (ENSMAMG00000009198)	UPRT (ENSMAMG00000009183)	zdhhc15b (ENSMAMG00000009160)	fgf16 (ENSMAMG00000024649)	atrx (ENSMAMG00000009118)	kif3a (ENSMAMG00000009053) #18	ENSMAMG00000009029 #19	kctd16a (ENSMAMG00000009008) #20	nr3c1 (ENSMAMG00000008984) #21	fgf1a (ENSMAMG00000025470) #22	ENSMAMG00000025853 #23	gnpda1 (ENSMAMG00000008865) #24	hspa4b (ENSMAMG00000008809) #25	ENSMAMG00000008800	ENSMAMG00000008784 #34	ENSMAMG00000008775 #35	ENSMAMG00000008748	ccng1 (ENSMAMG00000008739)	nudcd2 (ENSMAMG00000025206)	gabra6a (ENSMAMG00000008625)	gabrb2a (ENSMAMG00000008597)	ENSMAMG00000025757	ENSMAMG00000008496	atp7a (ENSMAMG00000008478) #36	sfxn1 (ENSMAMG00000008458)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	1	irg1l (ENSATEG00000005005)	si:ch211-153b23.5 (ENSATEG00000005023)	irg1l (ENSATEG00000005032)	glod5 (ENSATEG00000027212)	RLIM (ENSATEG00000005057)	NEXMIF (ENSATEG00000005080)	abcb7 (ENSATEG00000005099)	UPRT (ENSATEG00000005165)	zdhhc15b (ENSATEG00000005184)	fgf16 (ENSATEG00000005208)	atrx (ENSATEG00000005224)	kif3a (ENSATEG00000005239) #18	ENSATEG00000028880	kctd16a (ENSATEG00000005310) #20	nr3c1 (ENSATEG00000005344) #21	fgf1a (ENSATEG00000005352) #22	ENSATEG00000005358 #23	gnpda1 (ENSATEG00000005381) #24	hspa4b (ENSATEG00000005390) #25	ENSATEG00000027917	ENSATEG00000005477 #34	SOWAHA (ENSATEG00000005516) #35	ENSATEG00000005522	ccng1 (ENSATEG00000029682)	nudcd2 (ENSATEG00000029930)	gabra6a (ENSATEG00000005602)	gabrb2a (ENSATEG00000005873)	ENSATEG00000006064	atp7a (ENSATEG00000006145) #36	sfxn1 (ENSATEG00000006251)	ppp2caa (ENSATEG00000006296)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.5 (ENSBSLG00000017319)	irg1l (ENSBSLG00000017329)	ENSBSLG00000017392	glod5 (ENSBSLG00000017418)	RLIM (ENSBSLG00000017450)	NEXMIF (ENSBSLG00000017475)	abcb7 (ENSBSLG00000017558)	uprt (ENSBSLG00000018716)	zdhhc15b (ENSBSLG00000018734)	fgf16 (ENSBSLG00000019266)	ENSBSLG00000019285	kif3a (ENSBSLG00000020094) #18	ENSBSLG00000020440	kctd16a (ENSBSLG00000020444) #20	nr3c1 (ENSBSLG00000020446) #21	fgf1a (ENSBSLG00000020451) #22	NDFIP1 (ENSBSLG00000020477) #23	gnpda1 (ENSBSLG00000020486) #24	hspa4b (ENSBSLG00000020496) #25	gdf9 (ENSBSLG00000020635) #34	ENSBSLG00000020642 #35	septin8b (ENSBSLG00000020671)	ccng1 (ENSBSLG00000020787)	nudcd2 (ENSBSLG00000008259)	gabrb2a (ENSBSLG00000008315)	ATP10B (ENSBSLG00000008563)	atp7a (ENSBSLG00000009197) #36	sfxn1 (ENSBSLG00000009813)	ppp2caa (ENSBSLG00000009925)	atp5po (ENSBSLG00000009959)	si:ch1073-44g3.1 (ENSBSLG00000009999)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b.h	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	67	si:ch211-153b23.4 (ENSSDUG00000006671)	ENSSDUG00000006631	irg1l (ENSSDUG00000006609)	glod5 (ENSSDUG00000006599)	RLIM (ENSSDUG00000006593)	NEXMIF (ENSSDUG00000006587)	abcb7 (ENSSDUG00000006546)	uprt (ENSSDUG00000006519)	zdhhc15b (ENSSDUG00000006490)	fgf16 (ENSSDUG00000006371)	atrx (ENSSDUG00000006261)	kif3a (ENSSDUG00000006206) #18	ENSSDUG00000006193	kctd16a (ENSSDUG00000006177) #20	nr3c1 (ENSSDUG00000006165) #21	fgf1a (ENSSDUG00000006152) #22	NDFIP1 (ENSSDUG00000006132) #23	gnpda1 (ENSSDUG00000006115) #24	hspa4b (ENSSDUG00000006074) #25	uqcrq (ENSSDUG00000006065)	gdf9 (ENSSDUG00000006058) #34	ENSSDUG00000006044 #35	septin8b (ENSSDUG00000006014)	ccng1 (ENSSDUG00000005994)	nudcd2 (ENSSDUG00000005978)	gabra6a (ENSSDUG00000005828)	gabrb2a (ENSSDUG00000005532)	ATP10B (ENSSDUG00000005453)	ENSSDUG00000005431 #37	atp7a (ENSSDUG00000005325) #36	sfxn1 (ENSSDUG00000005288)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2581												kif3a (ENSSLDG00000013544) #18	ENSSLDG00000013597	kctd16a (ENSSLDG00000013616) #20	nr3c1 (ENSSLDG00000013625) #21	fgf1a (ENSSLDG00000013643) #22	NDFIP1 (ENSSLDG00000013654) #23	gnpda1 (ENSSLDG00000013669) #24	hspa4b (ENSSLDG00000013697) #25	uqcrq (ENSSLDG00000013761)	gdf9 (ENSSLDG00000013771) #34	ENSSLDG00000013788 #35	septin8b (ENSSLDG00000013820)	nudcd2 (ENSSLDG00000013862)	ccng1 (ENSSLDG00000013881)	gabra6a (ENSSLDG00000013893)	gabrb2a (ENSSLDG00000013927)	ENSSLDG00000014010	ENSSLDG00000014146 #37	atp7a (ENSSLDG00000014170) #36	sfxn1 (ENSSLDG00000014205)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	63	si:ch211-153b23.5 (ENSLCAG00010015088)	si:ch211-153b23.4 (ENSLCAG00010015092)	irg1l (ENSLCAG00010015095)	glod5 (ENSLCAG00010015102)	RLIM (ENSLCAG00010015110)	NEXMIF (ENSLCAG00010015113)	abcb7 (ENSLCAG00010015133)	uprt (ENSLCAG00010015177)	zdhhc15b (ENSLCAG00010015194)	fgf16 (ENSLCAG00010015236)	atrx (ENSLCAG00010015255)	kif3a (ENSLCAG00010015334) #18	ENSLCAG00010015355	kctd16a (ENSLCAG00010015379) #20	nr3c1 (ENSLCAG00010015384) #21	fgf1a (ENSLCAG00010015396) #22	NDFIP1 (ENSLCAG00010015407) #23	gnpda1 (ENSLCAG00010015430) #24	hspa4b (ENSLCAG00010015480) #25	uqcrq (ENSLCAG00010015576)	gdf9 (ENSLCAG00010015580) #34	septin8b (ENSLCAG00010015584)	ENSLCAG00010015598 #35	ccng1 (ENSLCAG00010015600)	nudcd2 (ENSLCAG00010015601)	gabra6a (ENSLCAG00010015604)	gabrb2a (ENSLCAG00010015614)	ATP10B (ENSLCAG00010015645)	ENSLCAG00010015662 #37	atp7a (ENSLCAG00010015678) #36	sfxn1 (ENSLCAG00010015699)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT01000000221770	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Tongue sole	MODERN SPECIES	6	ENSCSEG00000014853	irg1l (ENSCSEG00000014865)	glod5 (ENSCSEG00000014879)	RLIM (ENSCSEG00000014889)	NEXMIF (ENSCSEG00000014901)	abcb7 (ENSCSEG00000014908)	uprt (ENSCSEG00000014930)	zdhhc15b (ENSCSEG00000014934)	fgf16 (ENSCSEG00000014967)	atrx (ENSCSEG00000014977)	kif3a (ENSCSEG00000015042) #18	ENSCSEG00000015095 #19	ENSCSEG00000015104	kctd16a (ENSCSEG00000015107) #20	nr3c1 (ENSCSEG00000015111) #21	fgf1a (ENSCSEG00000015132) #22	NDFIP1 (ENSCSEG00000015181) #23	gnpda1 (ENSCSEG00000015197) #24	gnpda1 (ENSCSEG00000015205) #24	hspa4b (ENSCSEG00000015218) #25	septin8b (ENSCSEG00000015261)	gdf9 (ENSCSEG00000015272) #34	ENSCSEG00000015280 #35	ENSCSEG00000015282 #35	nudcd2 (ENSCSEG00000015289)	ccng1 (ENSCSEG00000015284)	gabra6a (ENSCSEG00000015301)	gabrb2a (ENSCSEG00000015327)	ENSCSEG00000015344	ENSCSEG00000015349 #37	atp7a (ENSCSEG00000015363) #36
Turbot	MODERN SPECIES	4	si:ch211-153b23.5 (ENSSMAG00000026559)	si:ch211-153b23.4 (ENSSMAG00000010067)	irg1l (ENSSMAG00000005426)	RLIM (ENSSMAG00000021649)	NEXMIF (ENSSMAG00000005369)	abcb7 (ENSSMAG00000005305)	UPRT (ENSSMAG00000005295)	zdhhc15b (ENSSMAG00000005256)	fgf16 (ENSSMAG00000005218)	atrx (ENSSMAG00000005192)	ENSSMAG00000005183	kif3a (ENSSMAG00000005060) #18	ENSSMAG00000005000	kctd16a (ENSSMAG00000004996) #20	nr3c1 (ENSSMAG00000004972) #21	fgf1a (ENSSMAG00000004967) #22	ENSSMAG00000025173 #23	gnpda1 (ENSSMAG00000004936) #24	hspa4b (ENSSMAG00000004855) #25	ENSSMAG00000004844	ENSSMAG00000004832 #34	ENSSMAG00000022620 #35	ENSSMAG00000004751	nudcd2 (ENSSMAG00000028352)	ccng1 (ENSSMAG00000029181)	gabra6a (ENSSMAG00000004712)	gabrb2a (ENSSMAG00000004657)	ENSSMAG00000004529	ENSSMAG00000004489 #37	atp7a (ENSSMAG00000004438) #36	sfxn1 (ENSSMAG00000004384)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875.lb.b #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.c	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875.lb.b #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.c	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	32													ENSGT00940000155875.lb.a #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.c	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Clown anemonefish	DUPLICATION
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	754																fgf1a (ENSAOCG00000016173) #22	NDFIP1 (ENSAOCG00000016204) #23	gnpda1 (ENSAOCG00000016220) #24	hspa4b (ENSAOCG00000016318) #25	uqcrq (ENSAOCG00000016340)	gdf9 (ENSAOCG00000016348) #34	ENSAOCG00000016364 #35	ENSAOCG00000016374	septin8b (ENSAOCG00000016401)	ccng1 (ENSAOCG00000016429)	nudcd2 (ENSAOCG00000016450)	gabra6a (ENSAOCG00000002031)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3647														kctd16a (ENSAOCG00000019152) #20	nr3c1 (ENSAOCG00000019197) #21	fgf1a (ENSAOCG00000019230) #22	NDFIP1 (ENSAOCG00000019262) #23
Orange clownfish	MODERN SPECIES	4	anxa5a (ENSAPEG00000000308)	ccna2 (ENSAPEG00000019431)	bbs7 (ENSAPEG00000019379)	tmem33 (ENSAPEG00000019346)	phox2bb (ENSAPEG00000019328)	LIMCH1 (ENSAPEG00000019181)	ENSAPEG00000019147	ENSAPEG00000019062	nanos1 (ENSAPEG00000019024)	ENSAPEG00000019013	mif (ENSAPEG00000019008)	ENSAPEG00000018986	ENSAPEG00000018977 #19	kctd16a (ENSAPEG00000018972) #20	nr3c1 (ENSAPEG00000018955) #21	fgf1a (ENSAPEG00000018936) #22	NDFIP1 (ENSAPEG00000018901) #23	gnpda1 (ENSAPEG00000018868) #24	hspa4b (ENSAPEG00000018807) #25	uqcrq (ENSAPEG00000018787)	gdf9 (ENSAPEG00000018761) #34	ENSAPEG00000018738 #35	septin8b (ENSAPEG00000018701)	ccng1 (ENSAPEG00000018681)	nudcd2 (ENSAPEG00000018665)	gabra6a (ENSAPEG00000018649)	gabrb2a (ENSAPEG00000018618)	ATP10B (ENSAPEG00000018500)	ENSAPEG00000018484 #37	atp7a (ENSAPEG00000018423) #36	sfxn1 (ENSAPEG00000018239)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1647												kif3a (ENSAPOG00000012902) #18	ENSAPOG00000012781 #19	kctd16a (ENSAPOG00000000342) #20	nr3c1 (ENSAPOG00000012757) #21	fgf1a (ENSAPOG00000012746) #22	NDFIP1 (ENSAPOG00000012717) #23	gnpda1 (ENSAPOG00000012667) #24	hspa4b (ENSAPOG00000012626) #25	uqcrq (ENSAPOG00000012529)	gdf9 (ENSAPOG00000012512) #34	septin8b (ENSAPOG00000012502)	ccng1 (ENSAPOG00000012427)	nudcd2 (ENSAPOG00000012391)	gabra6a (ENSAPOG00000012354)	gabrb2a (ENSAPOG00000012205)	ENSAPOG00000012141	ENSAPOG00000011947 #37	atp7a (ENSAPOG00000011912) #36	sfxn1 (ENSAPOG00000011816)	ppp2caa (ENSAPOG00000011785)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	592	si:ch211-153b23.5 (ENSSPAG00000012868)	irg1l (ENSSPAG00000012828)	glod5 (ENSSPAG00000012805)	RLIM (ENSSPAG00000012771)	NEXMIF (ENSSPAG00000012765)	ENSSPAG00000012741	abcb7 (ENSSPAG00000012679)	uprt (ENSSPAG00000012647)	zdhhc15b (ENSSPAG00000012628)	fgf16 (ENSSPAG00000012611)	atrx (ENSSPAG00000012566)	kif3a (ENSSPAG00000012515) #18	ENSSPAG00000012495 #19	kctd16a (ENSSPAG00000012488) #20	nr3c1 (ENSSPAG00000012471) #21	fgf1a (ENSSPAG00000012455) #22	NDFIP1 (ENSSPAG00000012428) #23	gnpda1 (ENSSPAG00000012398) #24	hspa4b (ENSSPAG00000012304) #25	uqcrq (ENSSPAG00000012281)	gdf9 (ENSSPAG00000012258) #34	ENSSPAG00000012250 #35	septin8b (ENSSPAG00000012225)	ccng1 (ENSSPAG00000012212)	nudcd2 (ENSSPAG00000012195)	gabra6a (ENSSPAG00000012170)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000163472.e.b.f	ENSGT00940000154393.s.b.a.a	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b.b #24	ENSGT00940000163472.e.b.f.d	ENSGT00940000154393.s.b.a.a	ENSGT00940000163472.e.b.f.c	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531
Nile tilapia	MODERN SPECIES	11	si:ch211-153b23.4 (ENSONIG00000017875)	ENSONIG00000028291	irg1l (ENSONIG00000017876)	glod5 (ENSONIG00000017880)	RLIM (ENSONIG00000017883)	NEXMIF (ENSONIG00000017886)	abcb7 (ENSONIG00000017887)	uprt (ENSONIG00000017888)	zdhhc15b (ENSONIG00000017893)	fgf16 (ENSONIG00000017896)	atrx (ENSONIG00000017898)	kif3a (ENSONIG00000017903) #18	ENSONIG00000037866	kctd16a (ENSONIG00000035407) #20	nr3c1 (ENSONIG00000017907) #21	fgf1a (ENSONIG00000017912) #22	NDFIP1 (ENSONIG00000032831) #23	gnpda1 (ENSONIG00000017916) #24	ENSONIG00000042271	ENSONIG00000041420	ENSONIG00000033729	ENSONIG00000012894	hspa4b (ENSONIG00000012895) #25	uqcrq (ENSONIG00000042672)	gdf9 (ENSONIG00000012904) #34	ENSONIG00000040995 #35	septin8b (ENSONIG00000012906)	nudcd2 (ENSONIG00000028204)	gabra6a (ENSONIG00000012917)	ccng1 (ENSONIG00000028753)	gabrb2a (ENSONIG00000012920)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b.b #24	ENSGT00940000163472.e.b.f.d	ENSGT00940000154393.s.b.a.a	ENSGT00940000163472.e.b.f.c	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	292	si:ch211-153b23.5 (ENSNBRG00000013408)	si:ch211-153b23.4 (ENSNBRG00000013392)	ENSNBRG00000013370	irg1l (ENSNBRG00000013354)	glod5 (ENSNBRG00000013345)	RLIM (ENSNBRG00000013331)	NEXMIF (ENSNBRG00000013324)	abcb7 (ENSNBRG00000013270)	uprt (ENSNBRG00000013241)	zdhhc15b (ENSNBRG00000013213)	fgf16 (ENSNBRG00000013118)	atrx (ENSNBRG00000013037)	kif3a (ENSNBRG00000012952) #18	kctd16a (ENSNBRG00000012932) #20	nr3c1 (ENSNBRG00000012902) #21	fgf1a (ENSNBRG00000012859) #22	NDFIP1 (ENSNBRG00000012830) #23	gnpda1 (ENSNBRG00000012814) #24	ENSNBRG00000012806	ENSNBRG00000012790	ENSNBRG00000012771	hspa4b (ENSNBRG00000012719) #25	uqcrq (ENSNBRG00000012700)	gdf9 (ENSNBRG00000012675) #34	ENSNBRG00000012663 #35	septin8b (ENSNBRG00000012635)	ccng1 (ENSNBRG00000012614)	nudcd2 (ENSNBRG00000012608)	gabra6a (ENSNBRG00000012568)	gabrb2a (ENSNBRG00000012536)	ATP10B (ENSNBRG00000012486)
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b.b #24	ENSGT00940000163472.e.b.f.d	ENSGT00940000154393.s.b.a.a	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	310	si:ch211-153b23.4 (ENSHBUG00000000013)	ENSHBUG00000001760	irg1l (ENSHBUG00000001766)	glod5 (ENSHBUG00000001783)	RLIM (ENSHBUG00000001799)	NEXMIF (ENSHBUG00000001803)	abcb7 (ENSHBUG00000001820)	uprt (ENSHBUG00000001829)	zdhhc15b (ENSHBUG00000001849)	fgf16 (ENSHBUG00000001863)	atrx (ENSHBUG00000001883)	kif3a (ENSHBUG00000001906) #18	ENSHBUG00000001923	kctd16a (ENSHBUG00000001929) #20	nr3c1 (ENSHBUG00000000846) #21	fgf1a (ENSHBUG00000001965) #22	NDFIP1 (ENSHBUG00000001977) #23	gnpda1 (ENSHBUG00000001995) #24	ENSHBUG00000002006	hspa4b (ENSHBUG00000002031) #25	uqcrq (ENSHBUG00000000023)	gdf9 (ENSHBUG00000002047) #34	ENSHBUG00000002052 #35	septin8b (ENSHBUG00000002067)	nudcd2 (ENSHBUG00000002085)	gabra6a (ENSHBUG00000002098)	gabrb2a (ENSHBUG00000002118)	ATP10B (ENSHBUG00000002153)	ENSHBUG00000002173 #37	atp7a (ENSHBUG00000002191) #36	ENSHBUG00000002199
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b.b #24	ENSGT00940000163472.e.b.f.d	ENSGT00940000154393.s.b.a.a	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b.b #24	ENSGT00390000014316.c.b.a #24	ENSGT00940000163472.e.b.f.c	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1102	si:ch211-153b23.4 (ENSMZEG00005011433)	ENSMZEG00005011450	irg1l (ENSMZEG00005011462)	glod5 (ENSMZEG00005011475)	RLIM (ENSMZEG00005011486)	NEXMIF (ENSMZEG00005011504)	abcb7 (ENSMZEG00005011515)	uprt (ENSMZEG00005011538)	zdhhc15b (ENSMZEG00005011558)	fgf16 (ENSMZEG00005011580)	atrx (ENSMZEG00005011594)	kif3a (ENSMZEG00005011622) #18	ENSMZEG00005011658 #19	kctd16a (ENSMZEG00005011667) #20	nr3c1 (ENSMZEG00005011670) #21	fgf1a (ENSMZEG00005011694) #22	NDFIP1 (ENSMZEG00005011717) #23	gnpda1 (ENSMZEG00005011736) #24	ENSMZEG00005011744	hspa4b (ENSMZEG00005011784) #25	uqcrq (ENSMZEG00005011831)	gdf9 (ENSMZEG00005011841) #34	septin8b (ENSMZEG00005011859)	ENSMZEG00005011910 #35	ccng1 (ENSMZEG00005011916)	nudcd2 (ENSMZEG00005011928)	gabra6a (ENSMZEG00005011940)	gabrb2a (ENSMZEG00005011954)	ENSMZEG00005011985	ENSMZEG00005012032 #37	atp7a (ENSMZEG00005012044) #36
Eastern happy	MODERN SPECIES	11	si:ch211-153b23.4 (ENSACLG00000005471)	ENSACLG00000005894	irg1l (ENSACLG00000005905)	glod5 (ENSACLG00000005922)	RLIM (ENSACLG00000005931)	NEXMIF (ENSACLG00000005945)	abcb7 (ENSACLG00000005983)	uprt (ENSACLG00000006041)	zdhhc15b (ENSACLG00000006069)	fgf16 (ENSACLG00000006080)	atrx (ENSACLG00000006093)	kif3a (ENSACLG00000006732) #18	ENSACLG00000006765 #19	kctd16a (ENSACLG00000006778) #20	nr3c1 (ENSACLG00000006789) #21	fgf1a (ENSACLG00000006803) #22	NDFIP1 (ENSACLG00000006807) #23	gnpda1 (ENSACLG00000006826) #24	ENSACLG00000006842	ENSACLG00000006852	hspa4b (ENSACLG00000006860) #25	uqcrq (ENSACLG00000006909)	gdf9 (ENSACLG00000006918) #34	septin8b (ENSACLG00000006927)	ENSACLG00000006975 #35	ccng1 (ENSACLG00000006987)	nudcd2 (ENSACLG00000006983)	gabra6a (ENSACLG00000007004)	gabrb2a (ENSACLG00000007014)	ENSACLG00000007051	ENSACLG00000007059
P. nyererei	MODERN SPECIES	296	si:ch211-153b23.4 (ENSPNYG00000000250)	ENSPNYG00000000251	irg1l (ENSPNYG00000000252)	glod5 (ENSPNYG00000000253)	RLIM (ENSPNYG00000000254)	NEXMIF (ENSPNYG00000000255)	abcb7 (ENSPNYG00000000257)	uprt (ENSPNYG00000000258)	zdhhc15b (ENSPNYG00000000259)	fgf16 (ENSPNYG00000000260)	atrx (ENSPNYG00000000261)	kif3a (ENSPNYG00000000262) #18	ENSPNYG00000000263	kctd16a (ENSPNYG00000000264) #20	nr3c1 (ENSPNYG00000000265) #21	fgf1a (ENSPNYG00000000266) #22	NDFIP1 (ENSPNYG00000000267) #23	gnpda1 (ENSPNYG00000000268) #24	ENSPNYG00000000269	ENSPNYG00000000270	hspa4b (ENSPNYG00000000271) #25	uqcrq (ENSPNYG00000000272)	gdf9 (ENSPNYG00000000273) #34	ENSPNYG00000000274 #35	septin8b (ENSPNYG00000000275)	nudcd2 (ENSPNYG00000000276)	ccng1 (ENSPNYG00000000277)	gabra6a (ENSPNYG00000000278)	gabrb2a (ENSPNYG00000000279)	ATP10B (ENSPNYG00000000280)	ENSPNYG00000000281 #37
Midas cichlid	MODERN SPECIES	974	ENSACIG00000006968	irg1l (ENSACIG00000006938)	ENSACIG00000006921	glod5 (ENSACIG00000006872)	RLIM (ENSACIG00000006846)	NEXMIF (ENSACIG00000006840)	abcb7 (ENSACIG00000006798)	uprt (ENSACIG00000006691)	zdhhc15b (ENSACIG00000006665)	fgf16 (ENSACIG00000006656)	atrx (ENSACIG00000006529)	ENSACIG00000006517	kif3a (ENSACIG00000006479) #18	kctd16a (ENSACIG00000006467) #20	nr3c1 (ENSACIG00000006445) #21	fgf1a (ENSACIG00000006424) #22	ndfip1l (ENSACIG00000006408) #23	gnpda1 (ENSACIG00000006237) #24	ENSACIG00000006213	ENSACIG00000006175	ENSACIG00000006165	hspa4b (ENSACIG00000006139) #25	uqcrq (ENSACIG00000006127)	gdf9 (ENSACIG00000006103) #34	ENSACIG00000006092 #35	septin8b (ENSACIG00000006078)	ccng1 (ENSACIG00000006059)	nudcd2 (ENSACIG00000006048)	gabra6a (ENSACIG00000006028)	gabrb2a (ENSACIG00000006008)	ATP10B (ENSACIG00000005908)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000001775.A	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155763.b	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000001775.A	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155763.b	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726.nb	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	16	si:ch211-153b23.5 (ENSOMEG00000007710)	si:ch211-153b23.4 (ENSOMEG00000007682)	ENSOMEG00000007661	irg1l (ENSOMEG00000007624)	RLIM (ENSOMEG00000007604)	NEXMIF (ENSOMEG00000007555)	abcb7 (ENSOMEG00000007510)	uprt (ENSOMEG00000007408)	zdhhc15b (ENSOMEG00000007372)	fgf16 (ENSOMEG00000007350)	atrx (ENSOMEG00000007314)	ENSOMEG00000007212 #19	ENSOMEG00000007171	kctd16a (ENSOMEG00000007154) #20	nr3c1 (ENSOMEG00000007143) #21	fgf1a (ENSOMEG00000007095) #22	NDFIP1 (ENSOMEG00000007123) #23	gnpda1 (ENSOMEG00000007063) #24	hspa4b (ENSOMEG00000006864) #25	uqcrq (ENSOMEG00000006769)	gdf9 (ENSOMEG00000006786) #34	ENSOMEG00000006754	ENSOMEG00000006740 #35	septin8b (ENSOMEG00000006717)	ccng1 (ENSOMEG00000006662)	nudcd2 (ENSOMEG00000006645)	gabra6a (ENSOMEG00000006626)	gabrb2a (ENSOMEG00000006602)	ENSOMEG00000006549	ENSOMEG00000006486 #37	atp7a (ENSOMEG00000006462) #36
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000003706.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000155875 #19	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.5 (ENSORLG00000006177)	si:ch211-153b23.4 (ENSORLG00000006169)	ENSORLG00000006161	irg1l (ENSORLG00000006152)	glod5 (ENSORLG00000006138)	RLIM (ENSORLG00000026942)	NEXMIF (ENSORLG00000006123)	abcb7 (ENSORLG00000006120)	uprt (ENSORLG00000006109)	zdhhc15b (ENSORLG00000006098)	fgf16 (ENSORLG00000006087)	atrx (ENSORLG00000006075)	ENSORLG00000006035 #19	kctd16a (ENSORLG00000006030) #20	nr3c1 (ENSORLG00000006022) #21	fgf1a (ENSORLG00000006013) #22	ENSORLG00000006004 #23	gnpda1 (ENSORLG00000005988) #24	hspa4b (ENSORLG00000005958) #25	uqcrq (ENSORLG00000024706)	gdf9 (ENSORLG00000024393) #34	ENSORLG00000005833 #35	septin8b (ENSORLG00000005830)	ccng1 (ENSORLG00000005817)	nudcd2 (ENSORLG00000005782)	gabra6a (ENSORLG00000005768)	gabrb2a (ENSORLG00000005749)	ENSORLG00000005735	atp7a (ENSORLG00000022734) #36	atp7a (ENSORLG00000005709) #36	sfxn1 (ENSORLG00000005583)
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159349	ENSGT00940000159591	ENSGT00390000002292.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a
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Mummichog	MODERN SPECIES	235	ccnjl (ENSFHEG00000012803)	C1QTNF2 (ENSFHEG00000012796)	slu7 (ENSFHEG00000012789)	glod5 (ENSFHEG00000012686)	RLIM (ENSFHEG00000012682)	NEXMIF (ENSFHEG00000012675)	abcb7 (ENSFHEG00000012671)	uprt (ENSFHEG00000012659)	zdhhc15b (ENSFHEG00000012631)	fgf16 (ENSFHEG00000012584)	atrx (ENSFHEG00000012570)	kif3a (ENSFHEG00000012374) #18	ENSFHEG00000011417	kctd16a (ENSFHEG00000011411) #20	nr3c1 (ENSFHEG00000011406) #21	fgf1a (ENSFHEG00000011371) #22	ndfip1l (ENSFHEG00000011365) #23	gnpda1 (ENSFHEG00000011321) #24	hspa4b (ENSFHEG00000011152) #25	uqcrq (ENSFHEG00000011099)	gdf9 (ENSFHEG00000011089) #34	SOWAHA (ENSFHEG00000011082) #35	septin8b (ENSFHEG00000011064)	ccng1 (ENSFHEG00000010988)	ENSFHEG00000010955	gabra6a (ENSFHEG00000010938)	ENSFHEG00000010902	gabrb2a (ENSFHEG00000010838)	ENSFHEG00000010476	ENSFHEG00000010324	atp7a (ENSFHEG00000010286) #36
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	143	C1QTNF2 (ENSCVAG00000019312)	slu7 (ENSCVAG00000019302)	glod5 (ENSCVAG00000019223)	RLIM (ENSCVAG00000019216)	NEXMIF (ENSCVAG00000019187)	abcb7 (ENSCVAG00000019177)	ENSCVAG00000019167	uprt (ENSCVAG00000019149)	zdhhc15b (ENSCVAG00000019109)	fgf16 (ENSCVAG00000019064)	atrx (ENSCVAG00000019038)	kif3a (ENSCVAG00000018881) #18	ENSCVAG00000018812	kctd16a (ENSCVAG00000018790) #20	nr3c1 (ENSCVAG00000018781) #21	fgf1a (ENSCVAG00000018767) #22	ndfip1l (ENSCVAG00000018760) #23	gnpda1 (ENSCVAG00000018752) #24	hspa4b (ENSCVAG00000018725) #25	uqcrq (ENSCVAG00000018664)	gdf9 (ENSCVAG00000018658) #34	ENSCVAG00000018636 #35	septin8b (ENSCVAG00000018622)	ccng1 (ENSCVAG00000018615)	nudcd2 (ENSCVAG00000018579)	gabra6a (ENSCVAG00000018557)	gabrb2a (ENSCVAG00000018531)	ENSCVAG00000018459	atp7a (ENSCVAG00000018227) #36	sfxn1 (ENSCVAG00000018100)	atp5po (ENSCVAG00000018053)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000015364.a.b.a	ENSGT00390000015364.a.b.b	ENSGT00390000015700.b	ENSGT00940000153941.a.b	ENSGT00940000155753	ENSGT00940000159746	ENSGT00940000156281	ENSGT01020000230412.D.b	ENSGT00940000158214	ENSGT00940000160087	ENSGT00940000155902.c	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491.ib #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1610	CU468142.1 (ENSNFUG00015002317)	glod5 (ENSNFUG00015002323)	RLIM (ENSNFUG00015002326)	KIAA2022 (ENSNFUG00015002332)	ENSNFUG00015002337	ABCB7 (ENSNFUG00015002359)	UPRT (ENSNFUG00015002431)	zdhhc15b (ENSNFUG00015002436)	fgf16 (ENSNFUG00015002447)	ENSNFUG00015002548	KIF3A (ENSNFUG00015003196) #18	ENSNFUG00015003228 #19	ENSNFUG00015003232	KCTD16A (ENSNFUG00015003238) #20	nr3c1 (ENSNFUG00015003243) #21	fgf1a (ENSNFUG00015003249) #22	NDFIP1 (ENSNFUG00015003259) #23	GNPDA1 (ENSNFUG00015003276) #24	hspa4b (ENSNFUG00015003337) #25	uqcrq (ENSNFUG00015003568)	gdf9 (ENSNFUG00015008903) #34	ENSNFUG00015008927 #35	SEPT8B (ENSNFUG00015009062)	CCNG1 (ENSNFUG00015009320)	NUDCD2 (ENSNFUG00015009344)	gabra6a (ENSNFUG00015009409)	gabrb2a (ENSNFUG00015009964)	ATP10B (ENSNFUG00015010148)	ENSNFUG00015010988 #37	atp7a (ENSNFUG00015011036) #36	sfxn1 (ENSNFUG00015011550)
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	76	si:ch211-153b23.4 (ENSKMAG00000006829)	ENSKMAG00000006792	irg1l (ENSKMAG00000006757)	glod5 (ENSKMAG00000006732)	RLIM (ENSKMAG00000006720)	NEXMIF (ENSKMAG00000006705)	abcb7 (ENSKMAG00000006629)	uprt (ENSKMAG00000006574)	zdhhc15b (ENSKMAG00000006538)	fgf16 (ENSKMAG00000006516)	atrx (ENSKMAG00000006460)	kif3a (ENSKMAG00000006374) #18	ENSKMAG00000006343	kctd16a (ENSKMAG00000006334) #20	nr3c1 (ENSKMAG00000006317) #21	fgf1a (ENSKMAG00000006301) #22	NDFIP1 (ENSKMAG00000006276) #23	gnpda1 (ENSKMAG00000006251) #24	hspa4b (ENSKMAG00000006228) #25	uqcrq (ENSKMAG00000006213)	gdf9 (ENSKMAG00000006187) #34	septin8b (ENSKMAG00000006130)	nudcd2 (ENSKMAG00000006070)	ccng1 (ENSKMAG00000006091)	gabra6a (ENSKMAG00000006029)	gabrb2a (ENSKMAG00000005990)	ATP10B (ENSKMAG00000005946)	ENSKMAG00000005917 #37	atp7a (ENSKMAG00000005839) #36	sfxn1 (ENSKMAG00000005788)	ppp2caa (ENSKMAG00000005743)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	175	ENSHCOG00000006047	ENSHCOG00000006011	glod5 (ENSHCOG00000006003)	RLIM (ENSHCOG00000000190)	NEXMIF (ENSHCOG00000005974)	abcb7 (ENSHCOG00000005956)	uprt (ENSHCOG00000005919)	zdhhc15b (ENSHCOG00000005904)	fgf16 (ENSHCOG00000005892)	atrx (ENSHCOG00000005865)	kif3a (ENSHCOG00000005671) #18	ENSHCOG00000005635 #19	ENSHCOG00000005628	kctd16a (ENSHCOG00000005617) #20	nr3c1 (ENSHCOG00000005606) #21	fgf1a (ENSHCOG00000005595) #22	NDFIP1 (ENSHCOG00000005534) #23	gnpda1 (ENSHCOG00000005515) #24	hspa4b (ENSHCOG00000005495) #25	uqcrq (ENSHCOG00000005457)	gdf9 (ENSHCOG00000005449) #34	ENSHCOG00000005441 #35	septin8b (ENSHCOG00000005437)	ccng1 (ENSHCOG00000005415)	gabra6a (ENSHCOG00000005395)	nudcd2 (ENSHCOG00000005388)	gabrb2a (ENSHCOG00000005378)	ENSHCOG00000005367	ENSHCOG00000000164	atp7a (ENSHCOG00000000841) #36	sfxn1 (ENSHCOG00000005258)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	1	si:ch211-153b23.5 (ENSMMDG00005008066)	si:ch211-153b23.4 (ENSMMDG00005008068)	irg1l (ENSMMDG00005008072)	glod5 (ENSMMDG00005008078)	RLIM (ENSMMDG00005008081)	NEXMIF (ENSMMDG00005008082)	abcb7 (ENSMMDG00005008126)	uprt (ENSMMDG00005009648)	zdhhc15b (ENSMMDG00005009664)	fgf16 (ENSMMDG00005009699)	atrx (ENSMMDG00005009742)	kif3a (ENSMMDG00005012985) #18	ENSMMDG00005013694 #19	kctd16a (ENSMMDG00005013696) #20	nr3c1 (ENSMMDG00005013698) #21	fgf1a (ENSMMDG00005013782) #22	NDFIP1 (ENSMMDG00005013785) #23	gnpda1 (ENSMMDG00005013790) #24	hspa4b (ENSMMDG00005013815) #25	gdf9 (ENSMMDG00005014599) #34	ENSMMDG00005014601 #35	septin8b (ENSMMDG00005014605)	ccng1 (ENSMMDG00005014612)	nudcd2 (ENSMMDG00005014614)	gabra6a (ENSMMDG00005014620)	gabrb2a (ENSMMDG00005014669)	ATP10B (ENSMMDG00005014682)	ENSMMDG00005014697 #37	atp7a (ENSMMDG00005014714) #36	sfxn1 (ENSMMDG00005015666)	ppp2caa (ENSMMDG00005015670)
Cod	MODERN SPECIES	1	ENSGMOG00000034758	irg1l (ENSGMOG00000006039)	zgc:174917 (ENSGMOG00000025367)	irg1l (ENSGMOG00000031965)	glod5 (ENSGMOG00000005960)	RLIM (ENSGMOG00000029618)	RLIM (ENSGMOG00000031968)	NEXMIF (ENSGMOG00000020192)	UPRT (ENSGMOG00000005875)	zdhhc15b (ENSGMOG00000005836)	ENSGMOG00000005751	kif3a (ENSGMOG00000005722) #18	ENSGMOG00000022664 #19	kctd16a (ENSGMOG00000005691) #20	nr3c1 (ENSGMOG00000005668) #21	fgf1a (ENSGMOG00000005658) #22	ENSGMOG00000024027 #23	gnpda1 (ENSGMOG00000005643) #24	hspa4b (ENSGMOG00000005602) #25	ENSGMOG00000032759 #34	ENSGMOG00000030469 #35	ENSGMOG00000005532	ENSGMOG00000005450	ENSGMOG00000020191	urp1 (ENSGMOG00000026552)	clic2 (ENSGMOG00000005434)	ENSGMOG00000005419	ocrl (ENSGMOG00000005366)	ENSGMOG00000023833	xpnpep2 (ENSGMOG00000005338)	SASH3 (ENSGMOG00000005306)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00440000040163	ENSGT00940000157209	ENSGT00940000158229	ENSGT00530000063872.A	ENSGT00940000158983	ENSGT00940000160481	ENSGT00390000006915.c.d.a	ENSGT00940000167495	ENSGT00940000159580	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160067	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b #23	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.b #25	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156722.b	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531	ENSGT00940000159491 #37	ENSGT00940000159568 #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b
Northern pike	MODERN SPECIES	3	fut11 (ENSELUG00000004392)	RAB9B (ENSELUG00000004378)	plp1a (ENSELUG00000024584)	pcdh20 (ENSELUG00000024539)	nlgn3a (ENSELUG00000024503)	ENSELUG00000024375	ENSELUG00000024245	ENSELUG00000024214	ENSELUG00000024148	ENSELUG00000034359	ENSELUG00000024034	kif3a (ENSELUG00000024021) #18	ENSELUG00000023931	ENSELUG00000023896 #21	kctd16a (ENSELUG00000023920) #20	fgf1a (ENSELUG00000023891) #22	NDFIP1 (ENSELUG00000023844) #23	gnpda1 (ENSELUG00000023817) #24	hspa4b (ENSELUG00000023803) #25	gdf9 (ENSELUG00000023686) #34	ENSELUG00000023342 #35	septin8b (ENSELUG00000023338)	ccng1 (ENSELUG00000030151)	nudcd2 (ENSELUG00000023272)	gabra6a (ENSELUG00000023227)	gabrb2a (ENSELUG00000023213)	ENSELUG00000023174	atp7a (ENSELUG00000023084) #36	sfxn1 (ENSELUG00000022974)	ppp2caa (ENSELUG00000022917)	ATP5PO (ENSELUG00000022874)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	276	ENSGT00440000040163.e	ENSGT00940000157209.f	ENSGT00940000158229.g	ENSGT00530000063872.A.c	ENSGT00940000158983	ENSGT00940000160481.h	ENSGT00390000006915.c.d.a.e	ENSGT00940000167495.d	ENSGT00940000159580	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n #18	ENSGT00940000155875.s.a.b #19	ENSGT00940000156071.a.h #20	ENSGT00940000156385.a.f #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b.c #23	ENSGT00390000014316.c.b.e.a #24	ENSGT00940000156067.g.b.e.b #25	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000156067.g.b.f #25	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.f	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.kb.d
Huchen	MODERN SPECIES	2774															nr3c1 (ENSHHUG00000003278) #21	fgf1a (ENSHHUG00000003306) #22	NDFIP1 (ENSHHUG00000003319) #23	gnpda1 (ENSHHUG00000003499) #24	hspa4b (ENSHHUG00000003517) #25	uqcrq (ENSHHUG00000004865)	gdf9 (ENSHHUG00000004878) #34	ENSHHUG00000004888 #35	septin8b (ENSHHUG00000004894)	ccng1 (ENSHHUG00000004980)	ENSHHUG00000005023	ENSHHUG00000005036
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00970000194185.B.b	ENSGT00440000040163.f	ENSGT00940000157209.e	ENSGT00940000158229.h	ENSGT00530000063872.A.d	ENSGT00940000160481.g	ENSGT00390000006915.c.d.a.f.b	ENSGT00940000167495.c	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n #18	ENSGT00940000155875.s.a.b #19	ENSGT00940000156071.a.h #20	ENSGT00940000156385.a.f #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b.c #23	ENSGT00390000014316.c.b.e.a #24	ENSGT00940000156067.g.b.e.b #25	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000156067.g.b.f #25	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.f	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b	ENSGT00940000159531.f	ENSGT00940000159491 #37
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.d.b	ENSGT00440000040163.f	ENSGT00940000157209.e	ENSGT00940000158229.h	ENSGT00530000063872.A.d	ENSGT00940000160481.g	ENSGT00390000006915.c.d.a.f.b	ENSGT00940000167495.c	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n #18	ENSGT00940000155875.s.a.b #19	ENSGT00940000156071.a.h #20	ENSGT00940000156385.a.f #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b.c #23	ENSGT00390000014316.c.b.e.a #24	ENSGT00940000156067.g.b.e.b #25	ENSGT00940000156067.g.b.f #25	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.f	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.a	ENSGT00940000159491.gb #37	ENSGT00940000159568.k.a #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.d.b	ENSGT00440000040163.f	ENSGT00940000157209.e	ENSGT00940000158229.h	ENSGT00530000063872.A.d	ENSGT00940000160481.g	ENSGT00390000006915.c.d.a.f.b	ENSGT00940000167495.c	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.b	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n #18	ENSGT00940000155875.s.a.b #19	ENSGT00940000156071.a.h #20	ENSGT00940000156385.a.f #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b.c #23	ENSGT00390000014316.c.b.e.a #24	ENSGT00940000156067.g.b.e.b #25	ENSGT00940000156067.g.b.f.a #25	ENSGT00390000004029.c.b	ENSGT00940000159784.k #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d #35	ENSGT00940000156068.j.f	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.a	ENSGT00940000159491.gb #37	ENSGT00940000159568.k.a #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	10	ENSOKIG00005005914	RAB9B (ENSOKIG00005005924)	plp1a (ENSOKIG00005005942)	pcdh20 (ENSOKIG00005005965)	nlgn3a (ENSOKIG00005006011)	ENSOKIG00005006257	ENSOKIG00005006270	ENSOKIG00005006298	ENSOKIG00005006367	ENSOKIG00005006387	kif3a (ENSOKIG00005006479) #18	ENSOKIG00005008430 #19	kctd16a (ENSOKIG00005008439) #20	ENSOKIG00005008447	nr3c1 (ENSOKIG00005008463) #21	fgf1a (ENSOKIG00005008480) #22	NDFIP1 (ENSOKIG00005008602) #23	gnpda1 (ENSOKIG00005008508) #24	hspa4b (ENSOKIG00005008739) #25	UQCRQ (ENSOKIG00005009683)	ENSOKIG00005009690 #34	septin8b (ENSOKIG00005009718)	ENSOKIG00005009966 #35	ccng1 (ENSOKIG00005009983)	ENSOKIG00005010005	gabra6a (ENSOKIG00005010017)	gabrb2a (ENSOKIG00005010038)	ENSOKIG00005010250	atp7a (ENSOKIG00005010437) #36	sfxn1 (ENSOKIG00005012833)	ppp2caa (ENSOKIG00005012858)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	13	zgc:66447 (ENSOTSG00005002697)	tmsb1 (ENSOTSG00005002814)	SLC25A53 (ENSOTSG00005002816)	prps1b (ENSOTSG00005002824)	FRMPD3 (ENSOTSG00005002826)	nsdhl (ENSOTSG00005002829)	CETN1 (ENSOTSG00005002837)	gcna (ENSOTSG00005002841)	ENSOTSG00005002843	ENSOTSG00005002848	OGT (ENSOTSG00005002927)	ENSOTSG00005007428	ENSOTSG00005007429	kctd16a (ENSOTSG00005007430) #20	nr3c1 (ENSOTSG00005007431) #21	fgf1a (ENSOTSG00005007432) #22	NDFIP1 (ENSOTSG00005007434) #23	gnpda1 (ENSOTSG00005007439) #24	hspa4b (ENSOTSG00005007462) #25	ENSOTSG00005014117	uqcrq (ENSOTSG00005014174)	gdf9 (ENSOTSG00005014177) #34	ENSOTSG00005014178 #35	septin8b (ENSOTSG00005014180)	ccng1 (ENSOTSG00005014248)	ENSOTSG00005014304	gabra6a (ENSOTSG00005014306)	ENSOTSG00005014307	ENSOTSG00005014310	ENSOTSG00005014311 #37	atp7a (ENSOTSG00005014313) #36
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00970000194185.B.b	ENSGT00440000040163.f	ENSGT00940000157209.e	ENSGT00940000158229.h	ENSGT00530000063872.A.d	ENSGT00940000160481.g	ENSGT00390000006915.c.d.a.f.b	ENSGT00940000167495.c	ENSGT00940000159580.r.b	ENSGT00940000156123.a.a	ENSGT00940000178948.a	ENSGT00940000156386.n #18	ENSGT00940000155875.s.a.b #19	ENSGT00940000156071.a.h #20	ENSGT00940000156385.a.f #21	ENSGT00940000165035.a #22	ENSGT00390000012721.a.g.b.c #23	ENSGT00390000014316.c.b.e.a #24	ENSGT00940000156067.g.b.e.b #25	ENSGT00390000004029.c.a.b	ENSGT00940000159784.k #34	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.d.m #35	ENSGT00940000156068.j.f	ENSGT00940000154726.rb.a	ENSGT00940000172088	ENSGT00940000156722.b.d	ENSGT00940000154245.A.jb.b.c	ENSGT00940000159568.k.a #36	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.b.q.b	ENSGT00550000074618.a.a.lb.a.d	ENSGT00390000014889.a.a
River trout	MODERN SPECIES	22	ENSSTUG00000013261	RAB9B (ENSSTUG00000013251)	plp1a (ENSSTUG00000013214)	pcdh20 (ENSSTUG00000013208)	ENSSTUG00000013192	ENSSTUG00000013174	ENSSTUG00000013169	ENSSTUG00000012893	ENSSTUG00000012860	ENSSTUG00000012827	kif3a (ENSSTUG00000012540) #18	ENSSTUG00000012485 #19	kctd16a (ENSSTUG00000012472) #20	ENSSTUG00000012457	nr3c1 (ENSSTUG00000012316) #21	fgf1a (ENSSTUG00000012303) #22	NDFIP1 (ENSSTUG00000012258) #23	gnpda1 (ENSSTUG00000012209) #24	hspa4b (ENSSTUG00000004613) #25	uqcrq (ENSSTUG00000004319)	gdf9 (ENSSTUG00000004307) #34	ENSSTUG00000004294 #35	septin8b (ENSSTUG00000003576)	ccng1 (ENSSTUG00000003509)	ENSSTUG00000003459	gabra6a (ENSSTUG00000003335)	gabrb2a (ENSSTUG00000003134)	sfxn1 (ENSSTUG00000003096)	ppp2caa (ENSSTUG00000003079)	si:ch1073-44g3.1 (ENSSTUG00000003074)	ENSSTUG00000002382
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000103320	ENSSSAG00000041797	hmmr (ENSSSAG00000041733)	cyfip2 (ENSSSAG00000015924)	ENSSSAG00000015374	itk (ENSSSAG00000041613)	ENSSSAG00000041995	ENSSSAG00000092242	ENSSSAG00000041820	gria1a (ENSSSAG00000106340)	13b2 (ENSSSAG00000068142)	ENSSSAG00000068150	ENSSSAG00000068195 #19	kctd16a (ENSSSAG00000086914) #20	nr3c1 (ENSSSAG00000121753) #21	fgf1a (ENSSSAG00000037964) #22	ENSSSAG00000038700 #23	gnpda1 (ENSSSAG00000044271) #24	hspa4b (ENSSSAG00000039557) #25	ENSSSAG00000044301 #34	ENSSSAG00000042611	ENSSSAG00000053980 #35	ccng1 (ENSSSAG00000102112)	NUDC2 (ENSSSAG00000053984)	gabra6a (ENSSSAG00000053996)	gabrb2a (ENSSSAG00000105666)	ENSSSAG00000054027	ENSSSAG00000054150 #37	atp7a (ENSSSAG00000108486) #36	sfxn1 (ENSSSAG00000105560)	pp2aa (ENSSSAG00000054285)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	195		ENSGT00390000018781	ENSGT00940000156386 #18	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000160067	ENSGT00950000182810.A.b	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b #35	ENSGT00940000156068.i
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	137	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00940000154049.a	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00940000153253.b.a	ENSGT00940000155974	ENSGT00390000013836	ENSGT00390000002172.A.a.e	ENSGT00940000161716.kc.b	ENSGT00940000155578.f	ENSGT00940000159751.x.b	ENSGT00940000161542	ENSGT00940000161811.a	ENSGT00940000159751.y
Atlantic herring	MODERN SPECIES	24	ENSCHAG00000002932	drd1b (ENSCHAG00000002951)	RAD50 (ENSCHAG00000003034)	ENSCHAG00000004800	pou4f3 (ENSCHAG00000004811)	RBM27 (ENSCHAG00000004835)	nsrp1 (ENSCHAG00000004910)	LARS1 (ENSCHAG00000004966)	PLAC8L1 (ENSCHAG00000006032)	GRXCR2 (ENSCHAG00000006064)	ENSCHAG00000006081	kctd16b (ENSCHAG00000006089) ##20	yipf5 (ENSCHAG00000006102)	NR3C1 (ENSCHAG00000006120) ##21	ARHGAP26 (ENSCHAG00000006304)	ENSCHAG00000011768 ##22	spry4 (ENSCHAG00000011777)	ndfip1l (ENSCHAG00000011787) #23	endou2 (ENSCHAG00000011911)	rnf14 (ENSCHAG00000011948)	hspa4a (ENSCHAG00000011973) ##25	ENSCHAG00000012924	nsun5 (ENSCHAG00000012931)	tbl2 (ENSCHAG00000013045)	bcl7ba (ENSCHAG00000013098)	ENSCHAG00000013108	ENSCHAG00000013128	ENSCHAG00000013236	ENSCHAG00000013256	or80a5 (ENSCHAG00000013266)	ENSCHAG00000013277
Denticle herring	MODERN SPECIES	16	CPEB4 (ENSDCDG00000035030) ##11	nsg2 (ENSDCDG00000035028)	msx2b (ENSDCDG00000035023) ##13	drd1b (ENSDCDG00000035021)	RAD50 (ENSDCDG00000034984)	pou4f3 (ENSDCDG00000034965)	RBM27 (ENSDCDG00000034963)	nsrp1 (ENSDCDG00000034959)	LARS1 (ENSDCDG00000034864)	PLAC8L1 (ENSDCDG00000034860)	GRXCR2 (ENSDCDG00000034858)	kctd16b (ENSDCDG00000034856) ##20	yipf5 (ENSDCDG00000034855)	NR3C1 (ENSDCDG00000034853) ##21	ARHGAP26 (ENSDCDG00000034407)	fgf1b (ENSDCDG00000034334) ##22	spry4 (ENSDCDG00000034332)	ndfip1l (ENSDCDG00000034317) #23	endou2 (ENSDCDG00000034309)	rnf14 (ENSDCDG00000034306)	ENSDCDG00000034305	hspa4a (ENSDCDG00000034139) ##25	ENSDCDG00000034127	nsun5 (ENSDCDG00000034124)	tbl2 (ENSDCDG00000034123)	bcl7ba (ENSDCDG00000034122)	ENSDCDG00000034121	myl10 (ENSDCDG00000034119)	CUX1 (ENSDCDG00000034118)	ENSDCDG00000034116	kctd7 (ENSDCDG00000034115)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	137	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781.x	ENSGT00390000018781.w.a	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	9	ENSIPUG00000010521	brcc3 (ENSIPUG00000010538)	FUNDC1 (ENSIPUG00000010565)	cmc4 (ENSIPUG00000010593)	TMEM164 (ENSIPUG00000010615)	ammecr1 (ENSIPUG00000010641)	kif4 (ENSIPUG00000010666)	RNF121 (ENSIPUG00000010700)	lars (ENSIPUG00000010756)	ENSIPUG00000010884	grxcr2 (ENSIPUG00000010891)	kctd16 (ENSIPUG00000010898) ##20	yipf5 (ENSIPUG00000010902)	nr3c1 (ENSIPUG00000010944) ##21	ARHGAP26 (ENSIPUG00000010994)	Fgf1 (ENSIPUG00000011328) ##22	spry4 (ENSIPUG00000011350)	NFI1L (ENSIPUG00000011367) #23	endou2 (ENSIPUG00000011459)	rnf14 (ENSIPUG00000011466)	HSPA4 (ENSIPUG00000011525) ##25	Zcchc10 (ENSIPUG00000011660)	aff4 (ENSIPUG00000011689)	ENSIPUG00000011720	ENSIPUG00000011754 ##35	septin8a (ENSIPUG00000011782)	stk26 (ENSIPUG00000011923)	tmem185a (ENSIPUG00000011988)	HTR2C (ENSIPUG00000012032)	ENSIPUG00000012063	GPR12 (ENSIPUG00000012125)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781.x	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781.x	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a.a ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00390000001134.b.`b.b	ENSGT00940000158972	ENSGT00940000157904.b	ENSGT00940000158388.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	73					drd1b (ENSPNAG00000027444)	RAD50 (ENSPNAG00000027413)	pou4f3 (ENSPNAG00000027241)	RBM27 (ENSPNAG00000027218)	LARS1 (ENSPNAG00000027191)	PLAC8L1 (ENSPNAG00000027048)	GRXCR2 (ENSPNAG00000005035)	kctd16b (ENSPNAG00000026987) ##20	yipf5 (ENSPNAG00000026975)	NR3C1 (ENSPNAG00000005159) ##21	ARHGAP26 (ENSPNAG00000006266)	fgf1b (ENSPNAG00000026613) ##22	spry4 (ENSPNAG00000026599)	ndfip1l (ENSPNAG00000026565) #23	endou2 (ENSPNAG00000026537)	rnf14 (ENSPNAG00000004066)	hspa4a (ENSPNAG00000004058) ##25	ENSPNAG00000026350	AFF4 (ENSPNAG00000004777)	ENSPNAG00000026258	SOWAHA (ENSPNAG00000005600) ##35	septin8a (ENSPNAG00000005865)	CCNI2 (ENSPNAG00000006260)	frmd7 (ENSPNAG00000026085)	stk26 (ENSPNAG00000005204)	tmem185 (ENSPNAG00000025933)	ANKRD46 (ENSPNAG00000025887)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	129															ENSAMXG00000040962	fgf1b (ENSAMXG00000043639) ##22	spry4 (ENSAMXG00000024962)	ndfip1l (ENSAMXG00000037274) #23	endou2 (ENSAMXG00000020081)	rnf14 (ENSAMXG00000020091)	hspa4a (ENSAMXG00000020109) ##25	ENSAMXG00000020130	ENSAMXG00000029234	AFF4 (ENSAMXG00000020137)	ENSAMXG00000041446	SOWAHA (ENSAMXG00000034243) ##35	septin8a (ENSAMXG00000020162)	CCNI2 (ENSAMXG00000035660)	ENSAMXG00000032265	ENSAMXG00000020185	frmd7 (ENSAMXG00000020194)
Electric eel	MODERN SPECIES	443					RAD50 (ENSEEEG00000006900)	pou4f3 (ENSEEEG00000006888)	RBM27 (ENSEEEG00000006885)	LARS1 (ENSEEEG00000005877)	PLAC8L1 (ENSEEEG00000005844)	GRXCR2 (ENSEEEG00000005843)	ENSEEEG00000005842	kctd16b (ENSEEEG00000005840) ##20	yipf5 (ENSEEEG00000005838)	NR3C1 (ENSEEEG00000005733) ##21	ARHGAP26 (ENSEEEG00000005709)	fgf1b (ENSEEEG00000005696) ##22	spry4 (ENSEEEG00000005695)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781.z.a	ENSGT00990000209912	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163.e	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	328	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a.b	ENSGT00940000164716.B.c ##13	ENSGT00940000155857.f.b.e	ENSGT00390000018781.z.a.b	ENSGT00990000209912.b	ENSGT00940000160880.f	ENSGT00510000046929.b.e	ENSGT00390000012163.e.b	ENSGT00940000160864.c	ENSGT00940000158849.a.b	ENSGT00940000156071.b.c ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.b	ENSGT00940000156385.b.c ##21	ENSGT00940000157254.s	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.c	ENSGT00390000012721.a.j.a.b #23	ENSGT00940000158744.b	ENSGT01060000248589.C.h	ENSGT00940000164188.h	ENSGT00940000159444.e	ENSGT00390000000360.a	ENSGT00960000187909	ENSGT00940000164188.g.a	ENSGT00940000159444.f	ENSGT00390000000360.b	ENSGT00940000154783	ENSGT00390000007430	ENSGT00390000010397.a.c.b	ENSGT00940000165351.i.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000154998.a.a.v ##11	ENSGT00390000000483.a.a.b	ENSGT00940000164716.B.c ##13	ENSGT00940000155857.f.b.e	ENSGT00390000018781.z.a.b	ENSGT00990000209912.b	ENSGT00940000160880.f	ENSGT00510000046929.b.e	ENSGT00390000012163.e.b	ENSGT00940000160864.c	ENSGT00940000158849.a.b	ENSGT00940000156071.b.c ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.b	ENSGT00940000156385.b.c ##21	ENSGT00940000157254.s	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.c	ENSGT00390000012721.a.j.a.b #23	ENSGT00940000158744.b	ENSGT01060000248589.C.h.b	ENSGT00940000164188.h	ENSGT00940000159444.e	ENSGT00390000000360.a	ENSGT00960000187909	ENSGT00940000154783	ENSGT00390000007430.g	ENSGT00390000010397.a.d	ENSGT00940000155150.b.b.e	ENSGT00390000001803	ENSGT00390000012412	ENSGT00940000159536.g
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	90	nsg2 (ENSSGRG00000054408)	msx2b (ENSSGRG00000054409) ##13	drd1b (ENSSGRG00000054410)	RAD50 (ENSSGRG00000054417)	ENSSGRG00000054462	il13 (ENSSGRG00000054463)	pou4f3 (ENSSGRG00000054464)	RBM27 (ENSSGRG00000054466)	LARS1 (ENSSGRG00000054471)	PLAC8L1 (ENSSGRG00000054475)	GRXCR2 (ENSSGRG00000054476)	kctd16b (ENSSGRG00000000084) ##20	yipf5 (ENSSGRG00000000087)	NR3C1 (ENSSGRG00000000143) ##21	ARHGAP26 (ENSSGRG00000000427)	fgf1b (ENSSGRG00000000429) ##22	spry4 (ENSSGRG00000000430)	ndfip1l (ENSSGRG00000000438) #23	mpp1 (ENSSGRG00000000477)	ENSSGRG00000000478
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	644			PXDN (ENSSGRG00000042554)	zgc:113142 (ENSSGRG00000042557)	CCR6 (ENSSGRG00000042559)	ATP6V1C2 (ENSSGRG00000042560)	nol10 (ENSSGRG00000042594)	odc1 (ENSSGRG00000042693)	exd2 (ENSSGRG00000042749)	GALNT16 (ENSSGRG00000042833)	vps39 (ENSSGRG00000042843)	FILIP1 (ENSSGRG00000043797)	tmem30aa (ENSSGRG00000043799)	cox7a2a (ENSSGRG00000043828)	COL12A1 (ENSSGRG00000043861)	fgf1b (ENSSGRG00000044172) ##22	insm1b (ENSSGRG00000044173)	kiz (ENSSGRG00000044201)	nkx2.4a (ENSSGRG00000044202)	nkx2.2a (ENSSGRG00000044205)	pax1a (ENSSGRG00000044210)	foxa2 (ENSSGRG00000044212)	PRKD3 (ENSSGRG00000044228)	ENSSGRG00000044356	mocs3 (ENSSGRG00000044360)	QPCT (ENSSGRG00000044362)	ENSSGRG00000044370	ENSSGRG00000044483	ENSSGRG00000044484	il10rb (ENSSGRG00000044503)	ENSSGRG00000044504
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	38	cpeb4b (ENSSGRG00000043538)	nsg2 (ENSSGRG00000043535)	msx2b (ENSSGRG00000043534) ##13	drd1b (ENSSGRG00000043533)	RAD50 (ENSSGRG00000043514)	il13 (ENSSGRG00000043508)	il13 (ENSSGRG00000043500)	pou4f3 (ENSSGRG00000043499)	RBM27 (ENSSGRG00000043498)	LARS1 (ENSSGRG00000042493)	PLAC8L1 (ENSSGRG00000042475)	kctd16b (ENSSGRG00000042474) ##20	yipf5 (ENSSGRG00000042473)	NR3C1 (ENSSGRG00000042443) ##21	ARHGAP26 (ENSSGRG00000042109)	fgf1b (ENSSGRG00000042105) ##22	spry4 (ENSSGRG00000042104)	ndfip1l (ENSSGRG00000041937) #23	mpp1 (ENSSGRG00000041859)	ENSSGRG00000041855	ENSSGRG00000041802	GABRA3 (ENSSGRG00000041764)	BRCC3 (ENSSGRG00000041751)	ENSSGRG00000041750	fundc2 (ENSSGRG00000041748)	TMEM164 (ENSSGRG00000041744)	ammecr1 (ENSSGRG00000041743)	ndufa2 (ENSSGRG00000041739)	cdx1b (ENSSGRG00000041738)	camk2a (ENSSGRG00000041685)	sra1 (ENSSGRG00000041677)
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Goldfish	MODERN SPECIES	13	il13 (ENSCARG00000022621)	il13 (ENSCARG00000022610)	pou4f3 (ENSCARG00000022604)	RBM27 (ENSCARG00000021894)	LARS1 (ENSCARG00000019794)	PLAC8L1 (ENSCARG00000019720)	GRXCR2 (ENSCARG00000019715)	kctd16b (ENSCARG00000019712) ##20	yipf5 (ENSCARG00000019696)	or70a16 (ENSCARG00000019686)	ENSCARG00000019679	or70a13 (ENSCARG00000019671)	or70a4 (ENSCARG00000019662)	NR3C1 (ENSCARG00000019579) ##21	ARHGAP26 (ENSCARG00000014716)	fgf1b (ENSCARG00000014561) ##22	spry4 (ENSCARG00000014557)	mpp1 (ENSCARG00000014055)	ENSCARG00000013972	GABRA3 (ENSCARG00000013735)	BRCC3 (ENSCARG00000013688)	fundc2 (ENSCARG00000013680)	TMEM164 (ENSCARG00000013669)	ammecr1 (ENSCARG00000013659)	ndufa2 (ENSCARG00000013647)	cdx1b (ENSCARG00000013644)	camk2a (ENSCARG00000013583)	sra1 (ENSCARG00000013570)	ENSCARG00000013565	pdlim4 (ENSCARG00000013561)	dkc1 (ENSCARG00000013500)
Zebrafish	MODERN SPECIES	13	ENSDARG00000116512	ENSDARG00000093353	ENSDARG00000093255	TMLHE (ENSDARG00000077547)	dkc1 (ENSDARG00000016484)	pdlim4 (ENSDARG00000068973)	ENSDARG00000053624	sra1 (ENSDARG00000053619)	camk2a (ENSDARG00000053617)	cdx1b (ENSDARG00000116139)	ik (ENSDARG00000004161)	ENSDARG00000117075	ndufa2 (ENSDARG00000021984)	ENSDARG00000087492	ENSDARG00000019713	fgf1b (ENSDARG00000042811) ##22	ENSDARG00000090883	zgc:136410 (ENSDARG00000102241)	BRCC3 (ENSDARG00000098242)	cmc4 (ENSDARG00000100774)	fundc2 (ENSDARG00000103740)	TMEM164 (ENSDARG00000113609)	spry4 (ENSDARG00000068732)	ammecr1 (ENSDARG00000012892)	kif4 (ENSDARG00000005462)	rnf121 (ENSDARG00000060282)	fstl4 (ENSDARG00000044319)	RAPGEF6 (ENSDARG00000010945)	ENSDARG00000090747	vdac1 (ENSDARG00000045132)	ENSDARG00000096305
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156198.c.b	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
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Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000005989.a.b.a.b.a ##10	ENSGT00940000156198.c.b.d	ENSGT00940000154998.a.a.w ##11	ENSGT00390000000483.a.a.d	ENSGT00940000164716.B.a ##13	ENSGT00940000155857.f.b.c	ENSGT00940000160880.g	ENSGT00510000046929.b.c	ENSGT00390000012163.d	ENSGT00940000160864.b	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.c	ENSGT00940000156385.b.e ##21	ENSGT00940000157254.q.a	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.f	ENSGT00390000012721.a.h.a #23	ENSGT00530000063825.A.d.d	ENSGT00940000154507.s.f	ENSGT00940000156067.g.a.i ##25	ENSGT00730000111200.hb	ENSGT00950000182974.a.a.b.n	ENSGT00940000160656.j	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i.b	ENSGT00940000162679.h	ENSGT00940000156685.x	ENSGT00940000159136.m	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b
Huchen	DUPLICATION
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Huchen	MODERN SPECIES	82															ENSHHUG00000028034	ENSHHUG00000028011 ##22	spry4 (ENSHHUG00000027983)	ndfip1l (ENSHHUG00000027971) #23	endou2 (ENSHHUG00000027922)	RNF14 (ENSHHUG00000027912)	hspa4a (ENSHHUG00000027635) ##25	zcchc10 (ENSHHUG00000027629)	AFF4 (ENSHHUG00000027608)	ENSHHUG00000027600	septin8a (ENSHHUG00000027329)	CCNI2 (ENSHHUG00000027319)	GABRG2 (ENSHHUG00000026936)	gabra1 (ENSHHUG00000026758)	GABRA6 (ENSHHUG00000026724)	GABRB2 (ENSHHUG00000026719)	ENSHHUG00000026709
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000005989.a.b.a.b.a ##10	ENSGT00940000156198.c.b.d	ENSGT00940000154998.a.a.w ##11	ENSGT00390000000483.a.a.d	ENSGT00940000164716.B.a ##13	ENSGT00940000155857.f.b.c	ENSGT00940000160880.g	ENSGT00510000046929.b.c	ENSGT00390000012163.d	ENSGT00940000160864.b	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.c	ENSGT00940000156385.b.e ##21	ENSGT00940000157254.q.a	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.f	ENSGT00390000012721.a.h.a #23	ENSGT00530000063825.A.d.d	ENSGT00940000154507.s.f	ENSGT00940000156067.g.a.i ##25	ENSGT00730000111200.hb	ENSGT00950000182974.a.a.b.n	ENSGT00940000160656.j	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i.b	ENSGT00940000162679.h	ENSGT00940000156685.x	ENSGT00940000159136.m	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005989.a.b.a.b.a ##10	ENSGT00940000156198.c.b.d	ENSGT00940000154998.a.a.w ##11	ENSGT00390000000483.a.a.d	ENSGT00940000164716.B.a ##13	ENSGT00940000155857.f.b.c	ENSGT00940000160880.g	ENSGT00510000046929.b.c	ENSGT00390000012163.d	ENSGT00940000160864.b	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.c	ENSGT00940000156385.b.e ##21	ENSGT00940000157254.q.a	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.f	ENSGT00390000012721.a.h.a #23	ENSGT00530000063825.A.d.d	ENSGT00940000154507.s.f	ENSGT00940000156067.g.a.i ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b.n	ENSGT00940000160656.j	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i.b	ENSGT00940000162679.h	ENSGT00940000156685.x	ENSGT00940000159136.m	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	23	CPEB4 (ENSSSAG00000079086) ##11	nsg2 (ENSSSAG00000117002)	msx2b (ENSSSAG00000117200) ##13	DRD1 (ENSSSAG00000079063)	pou4f3 (ENSSSAG00000079060)	RBM27 (ENSSSAG00000079044)	ENSSSAG00000079034	ENSSSAG00000114419	PLAC8L1 (ENSSSAG00000079022)	GRXCR2 (ENSSSAG00000102850)	KCTD16 (ENSSSAG00000079018) ##20	yipf5 (ENSSSAG00000097439)	ENSSSAG00000112728	NR3C1 (ENSSSAG00000078999) ##21	ARHGAP26 (ENSSSAG00000078318)	FGF1 (ENSSSAG00000078271) ##22	ENSSSAG00000110087	SPRY4 (ENSSSAG00000104116)	NDFIP1 (ENSSSAG00000078235) #23	ENSSSAG00000078231	RNF14 (ENSSSAG00000078228)	ENSSSAG00000078223	ENSSSAG00000078016 ##25	ENSSSAG00000103528	ZCH10 (ENSSSAG00000077977)	ENSSSAG00000077858	ENSSSAG00000077845	SOWAHA (ENSSSAG00000077842) ##35	sept8 (ENSSSAG00000076438)	ENSSSAG00000076407	GABRG2 (ENSSSAG00000075824)
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Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000005989.a.b.a.b.a ##10	ENSGT00940000156198.c.b.d	ENSGT00940000154998.a.a.w ##11	ENSGT00390000000483.a.a.d	ENSGT00940000164716.B.a ##13	ENSGT00940000155857.f.b.c	ENSGT00940000160880.g	ENSGT00510000046929.b.c	ENSGT00390000012163.d	ENSGT00940000160864.b	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.c	ENSGT00940000156385.b.e ##21	ENSGT00940000157254.q.a	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.f	ENSGT00390000012721.a.h.a #23	ENSGT00530000063825.A.d.d	ENSGT00940000154507.s.f	ENSGT00940000156067.g.a.i ##25	ENSGT00730000111200.hb	ENSGT00950000182974.a.a.b.n	ENSGT00940000160656.j	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i.b	ENSGT00940000162679.h	ENSGT00940000156685.x	ENSGT00940000159136.m	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00390000005989.a.b.a.b.a ##10	ENSGT00940000156198.c.b.d	ENSGT00940000154998.a.a.w ##11	ENSGT00390000000483.a.a.d	ENSGT00940000164716.B.a ##13	ENSGT00940000155857.f.b.c	ENSGT00940000160880.g	ENSGT00510000046929.b.c	ENSGT01000000221046	ENSGT00940000160864.b	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b.a ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a.c	ENSGT00940000156385.b.e ##21	ENSGT00940000157254.q.a	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.f	ENSGT00390000012721.a.h.a #23	ENSGT00530000063825.A.d.d	ENSGT00940000154507.s.f	ENSGT00940000156067.g.a.i ##25	ENSGT00730000111200.hb	ENSGT00950000182974.a.a.b.n	ENSGT00940000160656.j	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i.b	ENSGT00940000162679.h	ENSGT00940000156685.x	ENSGT00940000159136.m	ENSGT00940000156722.a.d	ENSGT00940000154245.A.kb.c.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	20	bod1 (ENSOKIG00005036294)	CPEB4 (ENSOKIG00005035997) ##11	nsg2 (ENSOKIG00005035972)	msx2b (ENSOKIG00005035967) ##13	drd1b (ENSOKIG00005035960)	POU4F3 (ENSOKIG00005035942)	RBM27 (ENSOKIG00005035894)	ENSOKIG00005035864	ENSOKIG00005035843	GRXCR2 (ENSOKIG00005035833)	ENSOKIG00005035824	kctd16b (ENSOKIG00005035812) ##20	yipf5 (ENSOKIG00005035792)	NR3C1 (ENSOKIG00005035497) ##21	ARHGAP26 (ENSOKIG00005034922)	fgf1b (ENSOKIG00005034848) ##22	ENSOKIG00005034841	SPRY4 (ENSOKIG00005034819)	NDFIP1 (ENSOKIG00005034762) #23	ENSOKIG00005034740	RNF14 (ENSOKIG00005034727)	hspa4a (ENSOKIG00005033802) ##25	zcchc10 (ENSOKIG00005033746)	AFF4 (ENSOKIG00005033733)	ENSOKIG00005033714	SOWAHA (ENSOKIG00005033706) ##35	septin8a (ENSOKIG00005031588)	ENSOKIG00005031483	GABRG2 (ENSOKIG00005030767)	gabra1 (ENSOKIG00005030557)	GABRA6 (ENSOKIG00005030442)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	23	CREBRF (ENSOTSG00005003593)	BNIP1 (ENSOTSG00005003594) ##8	STC2 (ENSOTSG00005003596) ##10	bod1 (ENSOTSG00005003597)	msx2b (ENSOTSG00005003600) ##13	drd1b (ENSOTSG00005003602)	pou4f3 (ENSOTSG00005003603)	RBM27 (ENSOTSG00005003606)	ENSOTSG00005003611	ENSOTSG00005003614	GRXCR2 (ENSOTSG00005003615)	kctd16b (ENSOTSG00005003616) ##20	yipf5 (ENSOTSG00005003618)	NR3C1 (ENSOTSG00005003629) ##21	ARHGAP26 (ENSOTSG00005003868)	fgf1b (ENSOTSG00005003871) ##22	spry4 (ENSOTSG00005003872)	ENSOTSG00005003874	RNF145 (ENSOTSG00005003879)	UBLCP1 (ENSOTSG00005004012)	ENSOTSG00005004014	ubtd2 (ENSOTSG00005004017)	adrb2b (ENSOTSG00005004018)	NDFIP1 (ENSOTSG00005004020) #23	endou2 (ENSOTSG00005004263)	ENSOTSG00005004266	hspa4a (ENSOTSG00005004283) ##25	zcchc10 (ENSOTSG00005005069)	AFF4 (ENSOTSG00005005070)	ENSOTSG00005005072	SOWAHA (ENSOTSG00005005073) ##35
Rainbow trout	MODERN SPECIES	1	nsg2 (ENSOMYG00000031369)	msx2b (ENSOMYG00000066549) ##13	ENSOMYG00000052445	ENSOMYG00000070641	drd1b (ENSOMYG00000031391)	POU4F3 (ENSOMYG00000031397)	RBM27 (ENSOMYG00000031407)	ENSOMYG00000031427	ENSOMYG00000072343	PLAC8L1 (ENSOMYG00000031448)	GRXCR2 (ENSOMYG00000031465)	kctd16b (ENSOMYG00000031471) ##20	yipf5 (ENSOMYG00000031487)	NR3C1 (ENSOMYG00000031572) ##21	ARHGAP26 (ENSOMYG00000031827)	ENSOMYG00000031854 ##22	ENSOMYG00000060773	ENSOMYG00000061901	SPRY4 (ENSOMYG00000031862)	nfip1 (ENSOMYG00000031901) #23	ENSOMYG00000067761	RNF14 (ENSOMYG00000031947)	hspa4a (ENSOMYG00000032117) ##25	zcchc10 (ENSOMYG00000032505)	AFF4 (ENSOMYG00000032517)	ENSOMYG00000032527	ENSOMYG00000032528	SOWAHA (ENSOMYG00000032535) ##35	septin8a (ENSOMYG00000032597)	ENSOMYG00000032699	ENSOMYG00000066971
Northern pike	MODERN SPECIES	6	drd1b (ENSELUG00000022986)	RAD50 (ENSELUG00000023093)	ENSELUG00000031816	ENSELUG00000000982	pou4f3 (ENSELUG00000023118)	RBM27 (ENSELUG00000023148)	LARS1 (ENSELUG00000023311)	PLAC8L1 (ENSELUG00000023177)	GRXCR2 (ENSELUG00000000989)	kctd16b (ENSELUG00000023335) ##20	ENSELUG00000027181	yipf5 (ENSELUG00000023350)	NR3C1 (ENSELUG00000023409) ##21	ARHGAP26 (ENSELUG00000023519)	ARHGAP26 (ENSELUG00000029002)	fgf1b (ENSELUG00000023539) ##22	spry4 (ENSELUG00000023554)	ndfip1l (ENSELUG00000033033) #23	endou2 (ENSELUG00000023584)	rnf14 (ENSELUG00000023620)	hspa4a (ENSELUG00000023695) ##25	zcchc10 (ENSELUG00000023728)	AFF4 (ENSELUG00000023871)	ENSELUG00000024882	ENSELUG00000028348	ENSELUG00000023915	SOWAHA (ENSELUG00000023939) ##35	septin8a (ENSELUG00000023981)	CCNI2 (ENSELUG00000024000)	GABRG2 (ENSELUG00000024074)	gabra1 (ENSELUG00000024116)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	4	ENSOMEG00000006103	CPEB4 (ENSOMEG00000000138) ##11	nsg2 (ENSOMEG00000006017)	msx2b (ENSOMEG00000006003) ##13	drd1b (ENSOMEG00000005994)	RAD50 (ENSOMEG00000005935)	pou4f3 (ENSOMEG00000005808)	RBM27 (ENSOMEG00000005785)	LARS1 (ENSOMEG00000005677)	PLAC8L1 (ENSOMEG00000005569)	GRXCR2 (ENSOMEG00000005551)	kctd16b (ENSOMEG00000005525) ##20	yipf5 (ENSOMEG00000005512)	NR3C1 (ENSOMEG00000005484) ##21	ARHGAP26 (ENSOMEG00000000119)	ENSOMEG00000005336 ##22	spry4 (ENSOMEG00000005320)	ndfip1l (ENSOMEG00000005304) #23	endou2 (ENSOMEG00000005264)	rnf14 (ENSOMEG00000005243)	hspa4a (ENSOMEG00000005193) ##25	zcchc10 (ENSOMEG00000005102)	AFF4 (ENSOMEG00000005078)	ENSOMEG00000005013	ENSOMEG00000000109 ##35	septin8a (ENSOMEG00000004959)	CCNI2 (ENSOMEG00000004930)	GABRG2 (ENSOMEG00000004910)	gabra1 (ENSOMEG00000004870)	GABRA6 (ENSOMEG00000004845)	GABRB2 (ENSOMEG00000004814)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	5	ENSOJAG00000011112	CPEB4 (ENSOJAG00000011160) ##11	nsg2 (ENSOJAG00000011373)	msx2b (ENSOJAG00000011395) ##13	drd1b (ENSOJAG00000011402)	RAD50 (ENSOJAG00000011480)	pou4f3 (ENSOJAG00000012111)	RBM27 (ENSOJAG00000012123)	LARS1 (ENSOJAG00000012350)	PLAC8L1 (ENSOJAG00000013679)	GRXCR2 (ENSOJAG00000013688)	kctd16b (ENSOJAG00000013698) ##20	yipf5 (ENSOJAG00000013710)	NR3C1 (ENSOJAG00000013765) ##21	ARHGAP26 (ENSOJAG00000013998)	ENSOJAG00000014311 ##22	spry4 (ENSOJAG00000014322)	ndfip1l (ENSOJAG00000014339) #23	endou2 (ENSOJAG00000014466)	rnf14 (ENSOJAG00000014491)	hspa4a (ENSOJAG00000014533) ##25	ENSOJAG00000014970	AFF4 (ENSOJAG00000014976)	ENSOJAG00000014993	ENSOJAG00000014998	ENSOJAG00000015017	SOWAHA (ENSOJAG00000015024) ##35	septin8a (ENSOJAG00000015153)	CCNI2 (ENSOJAG00000001727)	GABRG2 (ENSOJAG00000001922)	gabra1 (ENSOJAG00000002418)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Chinese medaka	MODERN SPECIES	365												kctd16b (ENSOSIG00000014647) ##20	yipf5 (ENSOSIG00000014643)	NR3C1 (ENSOSIG00000014612) ##21	ARHGAP26 (ENSOSIG00000007499)	fgf1b (ENSOSIG00000007442) ##22	spry4 (ENSOSIG00000007440)	ndfip1l (ENSOSIG00000007100) #23	endou2 (ENSOSIG00000007095)	HSPA4 (ENSOSIG00000005190) ##25	rnf14 (ENSOSIG00000005149)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	5	ENSORLG00000001719	CPEB4 (ENSORLG00000001711) ##11	nsg2 (ENSORLG00000026648)	ENSORLG00000026903 ##13	drd1b (ENSORLG00000001681)	RAD50 (ENSORLG00000001678)	pou4f3 (ENSORLG00000001657)	RBM27 (ENSORLG00000001645)	LARS1 (ENSORLG00000001622)	PLAC8L1 (ENSORLG00000026879)	GRXCR2 (ENSORLG00000001588)	kctd16b (ENSORLG00000001580) ##20	yipf5 (ENSORLG00000001576)	NR3C1 (ENSORLG00000001565) ##21	ARHGAP26 (ENSORLG00000001552)	ENSORLG00000001499 ##22	spry4 (ENSORLG00000001490)	ndfip1l (ENSORLG00000001479) #23	endou2 (ENSORLG00000001471)	rnf14 (ENSORLG00000001462)	hspa4a (ENSORLG00000001448) ##25	ENSORLG00000001372	AFF4 (ENSORLG00000001361)	ENSORLG00000030255	ENSORLG00000028838 ##35	septin8a (ENSORLG00000001313)	CCNI2 (ENSORLG00000001274)	GABRG2 (ENSORLG00000001267)	gabra1 (ENSORLG00000027019)	GABRA6 (ENSORLG00000018969)	GABRB2 (ENSORLG00000018987)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	58	ENSKMAG00000009356	CPEB4 (ENSKMAG00000009453) ##11	nsg2 (ENSKMAG00000009551)	msx2b (ENSKMAG00000009572) ##13	drd1b (ENSKMAG00000009582)	RAD50 (ENSKMAG00000009633)	pou4f3 (ENSKMAG00000009766)	RBM27 (ENSKMAG00000009801)	LARS1 (ENSKMAG00000009903)	PLAC8L1 (ENSKMAG00000010005)	GRXCR2 (ENSKMAG00000010041)	kctd16b (ENSKMAG00000010051) ##20	yipf5 (ENSKMAG00000010061)	NR3C1 (ENSKMAG00000010085) ##21	ARHGAP26 (ENSKMAG00000010140)	fgf1b (ENSKMAG00000010169) ##22	spry4 (ENSKMAG00000010183)	ndfip1l (ENSKMAG00000010223) #23	endou2 (ENSKMAG00000010243)	rnf14 (ENSKMAG00000010260)	hspa4a (ENSKMAG00000010299) ##25	ENSKMAG00000010417	AFF4 (ENSKMAG00000010443)	ENSKMAG00000010515	ENSKMAG00000010558 ##35	septin8a (ENSKMAG00000010785)	CCNI2 (ENSKMAG00000010841)	GABRG2 (ENSKMAG00000010884)	gabra1 (ENSKMAG00000010965)	GABRA6 (ENSKMAG00000011013)	GABRB2 (ENSKMAG00000011052)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1620	HMP19 (ENSNFUG00015006668)	msx2b (ENSNFUG00015006664) ##13	ENSNFUG00015006663	RAD50 (ENSNFUG00015006436)	ENSNFUG00015006399	POU4F3 (ENSNFUG00015006394)	RBM27 (ENSNFUG00015006341)	LARS1 (ENSNFUG00015004999)	PLAC8L1 (ENSNFUG00015024837)	ENSNFUG00015024833	GRXCR2 (ENSNFUG00015024830)	kctd16b (ENSNFUG00015024828) ##20	YIPF5 (ENSNFUG00015024825)	NR3C1 (ENSNFUG00015024817) ##21	ARHGAP26 (ENSNFUG00015024664)	ENSNFUG00015024647 ##22	SPRY4 (ENSNFUG00015024644)	ENSNFUG00015024641	ndfip1l (ENSNFUG00015024638) #23	endou2 (ENSNFUG00015024637)	RNF14 (ENSNFUG00015024636)	hspa4a (ENSNFUG00015024519) ##25	ENSNFUG00015024502	pitx1 (ENSNFUG00015024490)	H2AFY (ENSNFUG00015024478)	C21H5ORF4 (ENSNFUG00015024469)	LARP1 (ENSNFUG00015024238)	zgc:56585 (ENSNFUG00015024214)	ZNF346 (ENSNFUG00015024210)	fgfr4 (ENSNFUG00015015879)	ENSNFUG00015013052
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Sailfin molly	MODERN SPECIES	405										cherp (ENSPLAG00000003350)	ENSPLAG00000003334	kctd16b (ENSPLAG00000003328) ##20	yipf5 (ENSPLAG00000003310)	NR3C1 (ENSPLAG00000003268) ##21	ARHGAP26 (ENSPLAG00000003197)	ENSPLAG00000003072 ##22
Amazon molly	MODERN SPECIES	383											GRXCR2 (ENSPFOG00000005679)	kctd16b (ENSPFOG00000005777) ##20	yipf5 (ENSPFOG00000005795)	NR3C1 (ENSPFOG00000005866) ##21	ARHGAP26 (ENSPFOG00000006010)	ENSPFOG00000006585 ##22	spry4 (ENSPFOG00000023649)	spry4 (ENSPFOG00000023174)	ndfip1l (ENSPFOG00000006628) #23	endou2 (ENSPFOG00000006713)	rnf14 (ENSPFOG00000006823)	hspa4a (ENSPFOG00000006901) ##25	zcchc10 (ENSPFOG00000007040)	AFF4 (ENSPFOG00000007079)	ENSPFOG00000007375	ENSPFOG00000020752 ##35	septin8a (ENSPFOG00000007433)	CCNI2 (ENSPFOG00000007711)	GABRG2 (ENSPFOG00000007767)	gabra1 (ENSPFOG00000007969)	GABRA6 (ENSPFOG00000008151)
Guppy	MODERN SPECIES	444	ENSPREG00000006236	CPEB4 (ENSPREG00000006171) ##11	nsg2 (ENSPREG00000006151)	msx2b (ENSPREG00000006136) ##13	drd1b (ENSPREG00000006121)	RAD50 (ENSPREG00000005887)	pou4f3 (ENSPREG00000005851)	RBM27 (ENSPREG00000005827)	LARS1 (ENSPREG00000005668)	PLAC8L1 (ENSPREG00000005648)	GRXCR2 (ENSPREG00000005637)	kctd16b (ENSPREG00000005626) ##20	yipf5 (ENSPREG00000005606)	NR3C1 (ENSPREG00000005578) ##21	ARHGAP26 (ENSPREG00000005509)	ENSPREG00000005482 ##22	spry4 (ENSPREG00000005469)	ndfip1l (ENSPREG00000005437) #23	endou2 (ENSPREG00000005404)	rnf14 (ENSPREG00000005379)	hspa4a (ENSPREG00000005344) ##25	zcchc10 (ENSPREG00000005328)	AFF4 (ENSPREG00000005287)	ENSPREG00000005274	ENSPREG00000005270 ##35	septin8a (ENSPREG00000005238)	CCNI2 (ENSPREG00000005203)	GABRG2 (ENSPREG00000005126)	gabra1 (ENSPREG00000005068)	GABRA6 (ENSPREG00000005046)	GABRB2 (ENSPREG00000005004)
Platyfish	MODERN SPECIES	2	CPEB4 (ENSXMAG00000000294) ##11	nsg2 (ENSXMAG00000000291)	msx2b (ENSXMAG00000025273) ##13	drd1b (ENSXMAG00000020293)	RAD50 (ENSXMAG00000001353)	pou4f3 (ENSXMAG00000023685)	pou4f3 (ENSXMAG00000028993)	RBM27 (ENSXMAG00000001413)	LARS1 (ENSXMAG00000001454)	PLAC8L1 (ENSXMAG00000028460)	GRXCR2 (ENSXMAG00000001509)	kctd16b (ENSXMAG00000001512) ##20	yipf5 (ENSXMAG00000001514)	NR3C1 (ENSXMAG00000001522) ##21	ARHGAP26 (ENSXMAG00000001526)	ENSXMAG00000001555 ##22	spry4 (ENSXMAG00000029964)	ndfip1l (ENSXMAG00000029155) #23	endou2 (ENSXMAG00000001569)	rnf14 (ENSXMAG00000001585)	hspa4a (ENSXMAG00000001608) ##25	zcchc10 (ENSXMAG00000025729)	AFF4 (ENSXMAG00000001642)	ENSXMAG00000001683	SOWAHA (ENSXMAG00000023309) ##35	septin8a (ENSXMAG00000001689)	CCNI2 (ENSXMAG00000001709)	GABRG2 (ENSXMAG00000001711)	gabra1 (ENSXMAG00000012611)	GABRA6 (ENSXMAG00000012573)	GABRB2 (ENSXMAG00000012500)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Mummichog	MODERN SPECIES	2361												kctd16b (ENSFHEG00000004839) ##20	yipf5 (ENSFHEG00000004828)	NR3C1 (ENSFHEG00000004809) ##21	ARHGAP26 (ENSFHEG00000004749)	fgf1b (ENSFHEG00000004722) ##22	ENSFHEG00000004700	spry4 (ENSFHEG00000004686)	ndfip1l (ENSFHEG00000004674) #23	endou2 (ENSFHEG00000004652)	rnf14 (ENSFHEG00000004644)	hspa4a (ENSFHEG00000004628) ##25	zcchc10 (ENSFHEG00000004550)	AFF4 (ENSFHEG00000004526)	ENSFHEG00000004475	SOWAHA (ENSFHEG00000004469) ##35	septin8a (ENSFHEG00000004452)	CCNI2 (ENSFHEG00000004412)	ENSFHEG00000004398	GABRG2 (ENSFHEG00000004369)	gabra1 (ENSFHEG00000004328)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	385															ARHGAP26 (ENSCVAG00000009293)	ENSCVAG00000008924 ##22	ENSCVAG00000008912	chfr (ENSCVAG00000008839)	golga3 (ENSCVAG00000008831)	ankle2 (ENSCVAG00000008815)	pgam5 (ENSCVAG00000008773)	zdhhc8b (ENSCVAG00000008734)	ranbp1 (ENSCVAG00000008727)	ENSCVAG00000008708	trmt2a (ENSCVAG00000008685)	dgcr8 (ENSCVAG00000008664)	tango2 (ENSCVAG00000008605)	arvcfb (ENSCVAG00000008581)	TXNRD2 (ENSCVAG00000008543)	gnb1l (ENSCVAG00000008512)	tbx1 (ENSCVAG00000000889)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
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Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998.a.b	ENSGT00940000176998.a.a.a	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998.a.b	ENSGT00940000176998.a.a.a	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000176922.B.b.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998.a.b	ENSGT00940000176998.a.a.a	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
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Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	675														nr3c1 (ENSHBUG00000022339) ##21	ARHGAP26 (ENSHBUG00000022295)	fgf1b (ENSHBUG00000022171) ##22	spry4 (ENSHBUG00000022165)	ndfip1l (ENSHBUG00000022149) #23	rnf14 (ENSHBUG00000022134)	hspa4a (ENSHBUG00000022116) ##25	ENSHBUG00000021997	AFF4 (ENSHBUG00000021987)	ENSHBUG00000021962	ENSHBUG00000021938 ##35	septin8a (ENSHBUG00000021911)	CCNI2 (ENSHBUG00000021802)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	297	nsg2 (ENSNBRG00000005492)	msx2b (ENSNBRG00000005507) ##13	drd1b (ENSNBRG00000005539)	RAD50 (ENSNBRG00000005598)	ENSNBRG00000005689	ENSNBRG00000005720	pou4f3 (ENSNBRG00000005732)	RBM27 (ENSNBRG00000005739)	LARS1 (ENSNBRG00000005764)	PLAC8L1 (ENSNBRG00000005887)	GRXCR2 (ENSNBRG00000005914)	kctd16b (ENSNBRG00000005936) ##20	yipf5 (ENSNBRG00000005967)	NR3C1 (ENSNBRG00000005976) ##21	ARHGAP26 (ENSNBRG00000006023)	fgf1b (ENSNBRG00000006086) ##22	spry4 (ENSNBRG00000006099)	ndfip1l (ENSNBRG00000006121) #23	endou2 (ENSNBRG00000006137)	rnf14 (ENSNBRG00000006194)	hspa4a (ENSNBRG00000006219) ##25	ENSNBRG00000006271	ENSNBRG00000006285	AFF4 (ENSNBRG00000006303)	ENSNBRG00000006340	SOWAHA (ENSNBRG00000006356) ##35	septin8a (ENSNBRG00000006377)	CCNI2 (ENSNBRG00000006398)	GABRG2 (ENSNBRG00000006435)	gabra1 (ENSNBRG00000006481)	GABRA6 (ENSNBRG00000006521)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	1	msx2b (ENSONIG00000042795) ##13	RAD50 (ENSONIG00000008512)	ENSONIG00000041807	ENSONIG00000029234	ENSONIG00000036408	ENSONIG00000042767	pou4f3 (ENSONIG00000036406)	RBM27 (ENSONIG00000008506)	LARS1 (ENSONIG00000008493)	PLAC8L1 (ENSONIG00000033374)	GRXCR2 (ENSONIG00000008490)	kctd16b (ENSONIG00000008488) ##20	yipf5 (ENSONIG00000008486)	NR3C1 (ENSONIG00000008483) ##21	ARHGAP26 (ENSONIG00000008473)	fgf1 (ENSONIG00000034360) ##22	spry4 (ENSONIG00000031453)	ndfip1l (ENSONIG00000008465) #23	endou2 (ENSONIG00000008463)	rnf14 (ENSONIG00000008460)	hspa4a (ENSONIG00000008454) ##25	zcchc10 (ENSONIG00000034478)	AFF4 (ENSONIG00000008446)	ENSONIG00000038607	ENSONIG00000028267 ##35	septin8a (ENSONIG00000008438)	CCNI2 (ENSONIG00000008437)	GABRG2 (ENSONIG00000008436)	gabra1 (ENSONIG00000008432)	GABRA6 (ENSONIG00000008427)	GABRB2 (ENSONIG00000043045)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	469												kctd16b (ENSACIG00000011116) ##20	yipf5 (ENSACIG00000011102)	NR3C1 (ENSACIG00000010799) ##21	ARHGAP26 (ENSACIG00000010729)	fgf1b (ENSACIG00000010719) ##22	spry4 (ENSACIG00000010709)	NDFIP1 (ENSACIG00000010692) #23	endou2 (ENSACIG00000010671)	rnf14 (ENSACIG00000010648)	hspa4a (ENSACIG00000010612) ##25	zcchc10 (ENSACIG00000010605)	ENSACIG00000010592	AFF4 (ENSACIG00000010525)	ENSACIG00000010486	ENSACIG00000010472 ##35	septin8a (ENSACIG00000009699)	CCNI2 (ENSACIG00000009603)	GABRG2 (ENSACIG00000009566)	gabra1 (ENSACIG00000009534)	GABRA6 (ENSACIG00000009502)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00940000168656	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	2433																ENSAOCG00000003977 ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	6	CPEB4 (ENSAPEG00000017337) ##11	nsg2 (ENSAPEG00000017380)	msx2b (ENSAPEG00000017453) ##13	drd1b (ENSAPEG00000017467)	RAD50 (ENSAPEG00000017535)	ENSAPEG00000017640	pou4f3 (ENSAPEG00000017661)	RBM27 (ENSAPEG00000017681)	LARS1 (ENSAPEG00000017720)	PLAC8L1 (ENSAPEG00000017823)	GRXCR2 (ENSAPEG00000017834)	kctd16b (ENSAPEG00000017863) ##20	yipf5 (ENSAPEG00000017896)	NR3C1 (ENSAPEG00000017923) ##21	ARHGAP26 (ENSAPEG00000017953)	ENSAPEG00000018031 ##22	spry4 (ENSAPEG00000018043)	ndfip1l (ENSAPEG00000018059) #23	endou2 (ENSAPEG00000018083)	rnf14 (ENSAPEG00000018135)	hspa4a (ENSAPEG00000018179) ##25	ENSAPEG00000018258	AFF4 (ENSAPEG00000018275)	ENSAPEG00000018318	SOWAHA (ENSAPEG00000018334) ##35	septin8a (ENSAPEG00000018357)	CCNI2 (ENSAPEG00000018394)	GABRG2 (ENSAPEG00000018442)	gabra1 (ENSAPEG00000018467)	GABRA6 (ENSAPEG00000018522)	GABRB2 (ENSAPEG00000018559)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	296															ARHGAP26 (ENSAPOG00000006376)	fgf1b (ENSAPOG00000006357) ##22	spry4 (ENSAPOG00000006344)	ndfip1l (ENSAPOG00000006306) #23	endou2 (ENSAPOG00000006250)	rnf14 (ENSAPOG00000006225)	hspa4a (ENSAPOG00000006201) ##25	ENSAPOG00000006138	AFF4 (ENSAPOG00000006096)	ENSAPOG00000006054	SOWAHA (ENSAPOG00000006036) ##35	septin8a (ENSAPOG00000006030)	CCNI2 (ENSAPOG00000006004)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	264															ARHGAP26 (ENSSPAG00000011902)	fgf1b (ENSSPAG00000012115) ##22	spry4 (ENSSPAG00000012134)	ndfip1l (ENSSPAG00000012139) #23	endou2 (ENSSPAG00000012174)	rnf14 (ENSSPAG00000012229)	hspa4a (ENSSPAG00000012268) ##25	zcchc10 (ENSSPAG00000012331)	ENSSPAG00000012349	AFF4 (ENSSPAG00000012370)	ENSSPAG00000012399	ENSSPAG00000012417 ##35	septin8a (ENSSPAG00000012437)	CCNI2 (ENSSPAG00000012486)	GABRG2 (ENSSPAG00000012522)	gabra1 (ENSSPAG00000012551)	GABRA6 (ENSSPAG00000012576)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a.g ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.kb
Tetraodon	MODERN SPECIES	22	ENSTNIG00000018222	CPEB4 (ENSTNIG00000018221) ##11	nsg2 (ENSTNIG00000018220)	msx2b (ENSTNIG00000018219) ##13	drd1b (ENSTNIG00000018218)	RAD50 (ENSTNIG00000018217)	pou4f3 (ENSTNIG00000018216)	RBM27 (ENSTNIG00000018215)	LARS1 (ENSTNIG00000018214)	PLAC8L1 (ENSTNIG00000018213)	GRXCR2 (ENSTNIG00000018212)	kctd16b (ENSTNIG00000018211) ##20	yipf5 (ENSTNIG00000018210)	NR3C1 (ENSTNIG00000018209) ##21	ARHGAP26 (ENSTNIG00000018208)	ENSTNIG00000018207 ##22	spry4 (ENSTNIG00000018206)	ndfip1l (ENSTNIG00000018205) #23	endou2 (ENSTNIG00000018204)	rnf14 (ENSTNIG00000018203)	ENSTNIG00000018202 ##25	AFF4 (ENSTNIG00000018201)	ENSTNIG00000018200	ENSTNIG00000018199 ##35	septin8a (ENSTNIG00000018198)	CCNI2 (ENSTNIG00000018197)	GABRG2 (ENSTNIG00000018196)	gabra1 (ENSTNIG00000018195)	GABRA6 (ENSTNIG00000018194)	ENSTNIG00000004179	GABRB2 (ENSTNIG00000019742)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	331			drd1b (ENSLBEG00000024953)	RAD50 (ENSLBEG00000025013)	ENSLBEG00000025102	pou4f3 (ENSLBEG00000025119)	RBM27 (ENSLBEG00000025151)	LARS1 (ENSLBEG00000025237)	PLAC8L1 (ENSLBEG00000025331)	ENSLBEG00000025345	GRXCR2 (ENSLBEG00000025363)	kctd16b (ENSLBEG00000025381) ##20	yipf5 (ENSLBEG00000025400)	NR3C1 (ENSLBEG00000025423) ##21	ARHGAP26 (ENSLBEG00000025480)	fgf1b (ENSLBEG00000025555) ##22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160285	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	5	LTBP3 (ENSCLMG00005012257)	nsg2 (ENSCLMG00005012254)	ENSCLMG00005012253 ##13	ENSCLMG00005012252	drd1b (ENSCLMG00005012251)	RAD50 (ENSCLMG00005011823)	ENSCLMG00005011822	pou4f3 (ENSCLMG00005011821)	RBM27 (ENSCLMG00005011820)	LARS1 (ENSCLMG00005011773)	PLAC8L1 (ENSCLMG00005011763)	kctd16b (ENSCLMG00005011762) ##20	yipf5 (ENSCLMG00005011761)	NR3C1 (ENSCLMG00005011759) ##21	ARHGAP26 (ENSCLMG00005003832)	ENSCLMG00005003768 ##22	ndfip1l (ENSCLMG00005003702) #23	endou2 (ENSCLMG00005003700)	rnf14 (ENSCLMG00005003698)	hspa4a (ENSCLMG00005001879) ##25	zcchc10 (ENSCLMG00005001857)	AFF4 (ENSCLMG00005001838)	ENSCLMG00005001837	ENSCLMG00005001836 ##35	septin8a (ENSCLMG00005001528)	CCNI2 (ENSCLMG00005017579)	GABRG2 (ENSCLMG00005017457)	gabra1 (ENSCLMG00005017336)	GABRA6 (ENSCLMG00005017312)	GABRB2 (ENSCLMG00005017276)	SH3PXD2B (ENSCLMG00005017271)
Stickleback	MODERN SPECIES	7	ENSGACG00000020712	LTBP3 (ENSGACG00000020713)	nsg2 (ENSGACG00000020714)	ENSGACG00000020715 ##13	drd1b (ENSGACG00000020716)	RAD50 (ENSGACG00000020717)	pou4f3 (ENSGACG00000020718)	RBM27 (ENSGACG00000020719)	LARS1 (ENSGACG00000020720)	PLAC8L1 (ENSGACG00000020721)	GRXCR2 (ENSGACG00000020722)	kctd16b (ENSGACG00000020723) ##20	yipf5 (ENSGACG00000020724)	NR3C1 (ENSGACG00000020725) ##21	ARHGAP26 (ENSGACG00000020726)	fgf1b (ENSGACG00000020727) ##22	spry4 (ENSGACG00000020728)	ndfip1l (ENSGACG00000020729) #23	endou2 (ENSGACG00000020730)	rnf14 (ENSGACG00000020731)	hspa4a (ENSGACG00000020732) ##25	zcchc10 (ENSGACG00000020733)	AFF4 (ENSGACG00000020734)	ENSGACG00000020735	ENSGACG00000020736 ##35	septin8a (ENSGACG00000020737)	CCNI2 (ENSGACG00000020738)	GABRG2 (ENSGACG00000020739)	gabra1 (ENSGACG00000020740)	ENSGACG00000020741	GABRA6 (ENSGACG00000020742)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Pike perch	MODERN SPECIES	54	drd1b (ENSSLUG00000024876)	RAD50 (ENSSLUG00000024776)	ENSSLUG00000024760	pou4f3 (ENSSLUG00000024758)	RBM27 (ENSSLUG00000024751)	LARS1 (ENSSLUG00000024724)	PLAC8L1 (ENSSLUG00000024713)	ENSSLUG00000024709	ENSSLUG00000024705	GRXCR2 (ENSSLUG00000024704)	kctd16b (ENSSLUG00000024700) ##20	yipf5 (ENSSLUG00000024699)	NR3C1 (ENSSLUG00000024693) ##21	ENSSLUG00000024690	ARHGAP26 (ENSSLUG00000024583)	fgf1b (ENSSLUG00000024524) ##22	spry4 (ENSSLUG00000024520)	ndfip1l (ENSSLUG00000024510) #23	endou2 (ENSSLUG00000024506)	rnf14 (ENSSLUG00000024503)	hspa4a (ENSSLUG00000023959) ##25	zcchc10 (ENSSLUG00000023883)	AFF4 (ENSSLUG00000023828)	ENSSLUG00000023807	SOWAHA (ENSSLUG00000023805) ##35	septin8a (ENSSLUG00000023677)	CCNI2 (ENSSLUG00000023657)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	5	CPEB4 (ENSCGOG00000007257) ##11	nsg2 (ENSCGOG00000007329)	msx2b (ENSCGOG00000007332) ##13	drd1b (ENSCGOG00000007335)	RAD50 (ENSCGOG00000007389)	ENSCGOG00000008842	pou4f3 (ENSCGOG00000008847)	RBM27 (ENSCGOG00000008851)	LARS1 (ENSCGOG00000008893)	PLAC8L1 (ENSCGOG00000009099)	GRXCR2 (ENSCGOG00000009100)	kctd16b (ENSCGOG00000009102) ##20	yipf5 (ENSCGOG00000009107)	NR3C1 (ENSCGOG00000009121) ##21	ARHGAP26 (ENSCGOG00000009452)	ENSCGOG00000012107 ##22	spry4 (ENSCGOG00000012108)	ndfip1l (ENSCGOG00000012116) #23	endou2 (ENSCGOG00000012256)	rnf14 (ENSCGOG00000012262)	hspa4a (ENSCGOG00000012374) ##25	zcchc10 (ENSCGOG00000016863)	AFF4 (ENSCGOG00000016867)	ENSCGOG00000016875	ENSCGOG00000016880	SOWAHA (ENSCGOG00000016881) ##35	septin8a (ENSCGOG00000016990)	CCNI2 (ENSCGOG00000019522)	GABRG2 (ENSCGOG00000019544)	gabra1 (ENSCGOG00000019898)	GABRA6 (ENSCGOG00000019911)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	4	nsg2 (ENSSAUG00010009354)	msx2b (ENSSAUG00010009353) ##13	drd1b (ENSSAUG00010009352)	RAD50 (ENSSAUG00010008487)	ENSSAUG00010008480	ENSSAUG00010008477	pou4f3 (ENSSAUG00010008476)	RBM27 (ENSSAUG00010008475)	LARS1 (ENSSAUG00010005423)	PLAC8L1 (ENSSAUG00010005348)	GRXCR2 (ENSSAUG00010005347)	kctd16b (ENSSAUG00010005344) ##20	yipf5 (ENSSAUG00010005340)	NR3C1 (ENSSAUG00010005098) ##21	ARHGAP26 (ENSSAUG00010002443)	ENSSAUG00010002386 ##22	spry4 (ENSSAUG00010002384)	ndfip1l (ENSSAUG00010002216) #23	endou2 (ENSSAUG00010002197)	rnf14 (ENSSAUG00010002187)	hspa4a (ENSSAUG00010001704) ##25	zcchc10 (ENSSAUG00010024362)	AFF4 (ENSSAUG00010024359)	ENSSAUG00010024357	SOWAHA (ENSSAUG00010024356) ##35	septin8a (ENSSAUG00010024237)	CCNI2 (ENSSAUG00010024230)	ENSSAUG00010024227	tbl2 (ENSSAUG00010024225)	ENSSAUG00010024223	ENSSAUG00010024221
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
European seabass	MODERN SPECIES	4	ENSDLAG00005029664	ENSDLAG00005029522 ##13	ENSDLAG00005006020	drd1b (ENSDLAG00005033496)	ENSDLAG00005006064	ENSDLAG00005006927	pou4f3 (ENSDLAG00005006938)	ENSDLAG00005006948	LARS1 (ENSDLAG00005007002)	ENSDLAG00005007582	GRXCR2 (ENSDLAG00005007703)	kctd16b (ENSDLAG00005028013) ##20	yipf5 (ENSDLAG00005007714)	NR3C1 (ENSDLAG00005007724) ##21	ARHGAP26 (ENSDLAG00005007832)	ENSDLAG00005008529 ##22	SPRY4 (ENSDLAG00005030460)	NDFIP1 (ENSDLAG00005030480) #23	ENSDLAG00005008713	RNF14 (ENSDLAG00005008718)	hspa4a (ENSDLAG00005008744) ##25	zcchc10 (ENSDLAG00005009210)	AFF4 (ENSDLAG00005009218)	ENSDLAG00005009264	septin8a (ENSDLAG00005009337)	SOWAHA (ENSDLAG00005009271) ##35	ENSDLAG00005033087	GABRG2 (ENSDLAG00005011309)	gabra1 (ENSDLAG00005011616)	GABRA6 (ENSDLAG00005011772)	GABRB2 (ENSDLAG00005011797)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	493	msx2b (ENSLCRG00005011633) ##13	ENSLCRG00005011634	drd1b (ENSLCRG00005011635)	RAD50 (ENSLCRG00005011645)	ENSLCRG00005011790	ENSLCRG00005011791	pou4f3 (ENSLCRG00005011794)	RBM27 (ENSLCRG00005011797)	PLAC8L1 (ENSLCRG00005012192)	CYP8B1 (ENSLCRG00005012193)	GRXCR2 (ENSLCRG00005012196)	kctd16b (ENSLCRG00005012198) ##20	yipf5 (ENSLCRG00005012201)	NR3C1 (ENSLCRG00005012202) ##21	ARHGAP26 (ENSLCRG00005012211)	fgf1b (ENSLCRG00005012521) ##22	spry4 (ENSLCRG00005012523)	ndfip1l (ENSLCRG00005012534) #23	endou2 (ENSLCRG00005012696)	rnf14 (ENSLCRG00005012699)	hspa4a (ENSLCRG00005012711) ##25	zcchc10 (ENSLCRG00005014402)	AFF4 (ENSLCRG00005014406)	ENSLCRG00005014418	SOWAHA (ENSLCRG00005014420) ##35	septin8a (ENSLCRG00005014422)	CCNI2 (ENSLCRG00005014424)	GABRG2 (ENSLCRG00005014438)	gabra1 (ENSLCRG00005015321)	GABRA6 (ENSLCRG00005015558)	GABRB2 (ENSLCRG00005015579)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000166947	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Turbot	MODERN SPECIES	16	ENSSMAG00000001756	CPEB4 (ENSSMAG00000001696) ##11	ENSSMAG00000027238	ENSSMAG00000004353 ##13	drd1b (ENSSMAG00000004335)	ENSSMAG00000004161	pou4f3 (ENSSMAG00000004151)	RBM27 (ENSSMAG00000004138)	LARS1 (ENSSMAG00000004078)	PLAC8L1 (ENSSMAG00000022953)	GRXCR2 (ENSSMAG00000004394)	kctd16b (ENSSMAG00000004410) ##20	yipf5 (ENSSMAG00000004419)	NR3C1 (ENSSMAG00000004511) ##21	ARHGAP26 (ENSSMAG00000004561)	ENSSMAG00000004597 ##22	SPRY4 (ENSSMAG00000004612)	NDFIP1 (ENSSMAG00000036948) #23	ENSSMAG00000004645	RNF14 (ENSSMAG00000004650)	hspa4a (ENSSMAG00000004662) ##25	zcchc10 (ENSSMAG00000032607)	AFF4 (ENSSMAG00000004734)	ENSSMAG00000004815	SOWAHA (ENSSMAG00000004831) ##35	septin8a (ENSSMAG00000004842)	CCNI2 (ENSSMAG00000004864)	GABRG2 (ENSSMAG00000004886)	gabra1 (ENSSMAG00000004920)	GABRA6 (ENSSMAG00000004959)	GABRB2 (ENSSMAG00000005017)
Tongue sole	MODERN SPECIES	10	ruvbl2 (ENSCSEG00000011364)	ftr83 (ENSCSEG00000011391)	ftr82 (ENSCSEG00000011399)	atp5l (ENSCSEG00000011411)	nherf4b (ENSCSEG00000011455)	cltca (ENSCSEG00000011486)	ptrh2 (ENSCSEG00000011617)	ENSCSEG00000011623	rnft1 (ENSCSEG00000011652)	med13a (ENSCSEG00000011668)	ints2 (ENSCSEG00000011730)	AUTS2 (ENSCSEG00000011806)	ENSCSEG00000011872	ARHGAP26 (ENSCSEG00000012004)	ndfip1l (ENSCSEG00000012074) #23	fgf1b (ENSCSEG00000012102) ##22	spry4 (ENSCSEG00000012105)	endou2 (ENSCSEG00000012111)	rnf14 (ENSCSEG00000012116)	HSPA4 (ENSCSEG00000012129) ##25	alg5 (ENSCSEG00000012166)	ENSCSEG00000012196	rfxap (ENSCSEG00000012231)	dclk1a (ENSCSEG00000012243)	ENSCSEG00000012263	sparta (ENSCSEG00000012278)	SERTM1 (ENSCSEG00000012342)	ENSCSEG00000012359	ENSCSEG00000012413	rfc3 (ENSCSEG00000012450)	KL (ENSCSEG00000012460)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Barramundi perch	MODERN SPECIES	94	drd1b (ENSLCAG00010020156)	RAD50 (ENSLCAG00010020093)	ENSLCAG00010020048	ENSLCAG00010020044	ENSLCAG00010020043	pou4f3 (ENSLCAG00010020041)	RBM27 (ENSLCAG00010020035)	LARS1 (ENSLCAG00010019935)	PLAC8L1 (ENSLCAG00010019893)	CYP8B1 (ENSLCAG00010019891)	GRXCR2 (ENSLCAG00010019890)	kctd16b (ENSLCAG00010019888) ##20	yipf5 (ENSLCAG00010019885)	NR3C1 (ENSLCAG00010019875) ##21	ARHGAP26 (ENSLCAG00010019798)	ENSLCAG00010019779 ##22	spry4 (ENSLCAG00010019778)	ndfip1l (ENSLCAG00010019752) #23	endou2 (ENSLCAG00010019736)	rnf14 (ENSLCAG00010019733)	hspa4a (ENSLCAG00010018546) ##25	zcchc10 (ENSLCAG00010018286)	AFF4 (ENSLCAG00010018272)	ENSLCAG00010018267	ENSLCAG00010018262 ##35	septin8a (ENSLCAG00010018253)	CCNI2 (ENSLCAG00010018242)	GABRG2 (ENSLCAG00010018198)	gabra1 (ENSLCAG00010018189)	GABRA6 (ENSLCAG00010018184)	GABRB2 (ENSLCAG00010018176)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	139															ARHGAP26 (ENSSDUG00000019202)	ENSSDUG00000019317 ##22	spry4 (ENSSDUG00000019324)	ndfip1l (ENSSDUG00000019333) #23	endou2 (ENSSDUG00000019368)	rnf14 (ENSSDUG00000019373)	hspa4a (ENSSDUG00000019408) ##25	zcchc10 (ENSSDUG00000019487)	AFF4 (ENSSDUG00000019498)	ENSSDUG00000019549	SOWAHA (ENSSDUG00000019599) ##35	septin8a (ENSSDUG00000019607)	CCNI2 (ENSSDUG00000019631)	GABRG2 (ENSSDUG00000019640)	gabra1 (ENSSDUG00000019654)	GABRA6 (ENSSDUG00000019671)	GABRB2 (ENSSDUG00000019683)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3182	CPEB4 (ENSSLDG00000006601) ##11	nsg2 (ENSSLDG00000006661)	msx2b (ENSSLDG00000006681) ##13	drd1b (ENSSLDG00000006695)	RAD50 (ENSSLDG00000006735)	ENSSLDG00000006869	pou4f3 (ENSSLDG00000006890)	RBM27 (ENSSLDG00000006922)	LARS1 (ENSSLDG00000007054)	PLAC8L1 (ENSSLDG00000007161)	GRXCR2 (ENSSLDG00000007195)	kctd16b (ENSSLDG00000007214) ##20	yipf5 (ENSSLDG00000007233)	NR3C1 (ENSSLDG00000007270) ##21	ARHGAP26 (ENSSLDG00000007338)	ENSSLDG00000007455 ##22	spry4 (ENSSLDG00000007475)	ndfip1l (ENSSLDG00000007502) #23	endou2 (ENSSLDG00000007540)	rnf14 (ENSSLDG00000007562)	hspa4a (ENSSLDG00000007611) ##25	zcchc10 (ENSSLDG00000007657)	AFF4 (ENSSLDG00000007683)	ENSSLDG00000007763	SOWAHA (ENSSLDG00000007803) ##35	septin8a (ENSSLDG00000007839)	CCNI2 (ENSSLDG00000007903)	GABRG2 (ENSSLDG00000007939)	gabra1 (ENSSLDG00000008029)	GABRA6 (ENSSLDG00000008075)	GABRB2 (ENSSLDG00000008129)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	5	CPEB4 (ENSMAMG00000021359) ##11	ENSMAMG00000021360	ENSMAMG00000026156 ##13	drd1b (ENSMAMG00000021363)	ENSMAMG00000021367	ENSMAMG00000021380	pou4f3 (ENSMAMG00000021381)	RBM27 (ENSMAMG00000021382)	LARS1 (ENSMAMG00000021385)	PLAC8L1 (ENSMAMG00000021392)	GRXCR2 (ENSMAMG00000027184)	kctd16b (ENSMAMG00000021397) ##20	yipf5 (ENSMAMG00000024924)	NR3C1 (ENSMAMG00000021400) ##21	ARHGAP26 (ENSMAMG00000021404)	ENSMAMG00000021411 ##22	ENSMAMG00000008160	SPRY4 (ENSMAMG00000024910)	NDFIP1 (ENSMAMG00000027588) #23	ENSMAMG00000021425	RNF14 (ENSMAMG00000021429)	hspa4a (ENSMAMG00000021436) ##25	zcchc10 (ENSMAMG00000021448)	AFF4 (ENSMAMG00000021453)	ENSMAMG00000021459	ENSMAMG00000021462 ##35	septin8a (ENSMAMG00000021464)	CCNI2 (ENSMAMG00000021468)	ENSMAMG00000025987	GABRG2 (ENSMAMG00000021473)	gabra1 (ENSMAMG00000021477)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154998.a.a ##11	ENSGT00390000000483.a.a	ENSGT00940000164716.B ##13	ENSGT00940000155857.f.b	ENSGT00390000018781	ENSGT00940000176998	ENSGT00940000160880	ENSGT00510000046929.b	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160864	ENSGT00940000158849	ENSGT00940000156071.b ##20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.b ##21	ENSGT00940000157254.r	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b	ENSGT00390000012721.a.g.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00940000154507.s	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00730000111200	ENSGT00950000182974.a.a.b	ENSGT00940000160656	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.c ##35	ENSGT00940000156068.i	ENSGT00940000162679	ENSGT00940000156685	ENSGT00940000159136	ENSGT00940000156722.a	ENSGT00940000154245.A.jb.a
Climbing perch	MODERN SPECIES	5	ENSATEG00000027859	ENSATEG00000029651 ##13	drd1b (ENSATEG00000010207)	ENSATEG00000010239	ENSATEG00000010338	ENSATEG00000010350	pou4f3 (ENSATEG00000010368)	RBM27 (ENSATEG00000010385)	LARS1 (ENSATEG00000010441)	PLAC8L1 (ENSATEG00000010528)	GRXCR2 (ENSATEG00000010553)	kctd16b (ENSATEG00000010581) ##20	yipf5 (ENSATEG00000010591)	NR3C1 (ENSATEG00000010600) ##21	ARHGAP26 (ENSATEG00000010645)	ENSATEG00000010742 ##22	SPRY4 (ENSATEG00000025572)	NDFIP1 (ENSATEG00000010763) #23	ENSATEG00000010793	RNF14 (ENSATEG00000010831)	hspa4a (ENSATEG00000010850) ##25	zcchc10 (ENSATEG00000010945)	AFF4 (ENSATEG00000010963)	ENSATEG00000010997	ENSATEG00000029418 ##35	septin8a (ENSATEG00000011056)	CCNI2 (ENSATEG00000011108)	GABRG2 (ENSATEG00000011122)	gabra1 (ENSATEG00000011169)	GABRA6 (ENSATEG00000011194)	GABRB2 (ENSATEG00000011255)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	214											kctd16b (ENSHCOG00000015646) ##20	yipf5 (ENSHCOG00000015662)	NR3C1 (ENSHCOG00000015703) ##21	ENSHCOG00000015715	ARHGAP26 (ENSHCOG00000015763)	ENSHCOG00000016029 ##22	spry4 (ENSHCOG00000016045)	ndfip1l (ENSHCOG00000016063) #23	endou2 (ENSHCOG00000016078)	rnf14 (ENSHCOG00000016085)	hspa4a (ENSHCOG00000016162) ##25	zcchc10 (ENSHCOG00000016175)	AFF4 (ENSHCOG00000016280)	ENSHCOG00000016300	SOWAHA (ENSHCOG00000016320) ##35	septin8a (ENSHCOG00000016344)	CCNI2 (ENSHCOG00000016350)	GABRG2 (ENSHCOG00000016377)	gabra1 (ENSHCOG00000000467)	GABRA6 (ENSHCOG00000016715)	GABRB2 (ENSHCOG00000016727)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	5	ENSMMDG00005012475	msx2b (ENSMMDG00005012471) ##13	drd1b (ENSMMDG00005012470)	ENSMMDG00005012469	RAD50 (ENSMMDG00005011294)	pou4f3 (ENSMMDG00005011267)	RBM27 (ENSMMDG00005011263)	LARS1 (ENSMMDG00005008561)	PLAC8L1 (ENSMMDG00005008509)	GRXCR2 (ENSMMDG00005008506)	ENSMMDG00005008503	kctd16b (ENSMMDG00005008499) ##20	yipf5 (ENSMMDG00005008496)	NR3C1 (ENSMMDG00005008492) ##21	ARHGAP26 (ENSMMDG00005008047)	fgf1b (ENSMMDG00005008008) ##22	spry4 (ENSMMDG00005008005)	ndfip1l (ENSMMDG00005007999) #23	endou2 (ENSMMDG00005007993)	rnf14 (ENSMMDG00005007987)	hspa4a (ENSMMDG00005006586) ##25	zcchc10 (ENSMMDG00005006555)	AFF4 (ENSMMDG00005006548)	ENSMMDG00005006546	SOWAHA (ENSMMDG00005006545) ##35	septin8a (ENSMMDG00005006421)	CCNI2 (ENSMMDG00005006401)	GABRG2 (ENSMMDG00005006065)	gabra1 (ENSMMDG00005005810)	GABRA6 (ENSMMDG00005005759)	GABRB2 (ENSMMDG00005005706)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000005989.a.a.a ##10	ENSGT00940000154998.a.a.t ##11	ENSGT00390000000483.a.a.f	ENSGT00940000159824	ENSGT00940000155857.f.a	ENSGT00940000156386.d #18	ENSGT00940000160880.c	ENSGT00510000046929.b.h	ENSGT00390000012163	ENSGT00940000160067	ENSGT00950000182810.A.b	ENSGT00940000156071.a #20	ENSGT00940000153168.C.a.a	ENSGT00940000156385.a #21	ENSGT00940000157254.o	ENSGT00940000165035.b ##22	ENSGT00950000183055.b.b.b	ENSGT00390000012721.a #23	ENSGT00530000063825.A.d	ENSGT00390000014316.c.b #24	ENSGT00940000156067.g.a ##25	ENSGT00950000182974.a.a.b.j	ENSGT00390000004029	ENSGT00940000159784 #34	ENSGT00940000160656.d	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.b.e #35	ENSGT00940000156068.j	ENSGT00940000162679.c	ENSGT00940000154726	ENSGT00390000001644	ENSGT00940000156685.y.a
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	442												kctd16a (ENSPKIG00000024111) #20	yipf5 (ENSPKIG00000024119)	NR3C1 (ENSPKIG00000024131) #21	ARHGAP26 (ENSPKIG00000024147)	fgf1b (ENSPKIG00000024173) ##22	spry4 (ENSPKIG00000024184)	ndfip1l (ENSPKIG00000024194) #23	endou2 (ENSPKIG00000024238)	gnpda1 (ENSPKIG00000024252) #24	HSPA4 (ENSPKIG00000024274) ##25	AFF4 (ENSPKIG00000024325)	uqcrq (ENSPKIG00000024365)	gdf9 (ENSPKIG00000024372) #34	ENSPKIG00000024384	SOWAHA (ENSPKIG00000024393) #35	septin8b (ENSPKIG00000024403)	CCNI2 (ENSPKIG00000024425)	ccng1 (ENSPKIG00000024439)	nudcd2 (ENSPKIG00000024450)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	4	nkx2.5 (ENSSFOG00015017890) #9	STC2 (ENSSFOG00015017907) ##10	CPEB4 (ENSSFOG00015017925) ##11	NSG2 (ENSSFOG00015017958)	MSX2 (ENSSFOG00015025283)	DRD1 (ENSSFOG00015017983)	pou4f3 (ENSSFOG00015017993)	RBM27 (ENSSFOG00015018009)	LARS1 (ENSSFOG00015018117)	SH3RF2 (ENSSFOG00015018215)	PRELID2 (ENSSFOG00015018273)	kctd16a (ENSSFOG00015018302) #20	yipf5 (ENSSFOG00015031270)	nr3c1 (ENSSFOG00015018348) #21	ARHGAP26 (ENSSFOG00015018403)	ENSSFOG00015018500 ##22	spry4 (ENSSFOG00015018544)	ndfip1 (ENSSFOG00015025334) #23	endou2 (ENSSFOG00015018551)	gnpda1 (ENSSFOG00015018565) #24	HSPA4 (ENSSFOG00015018589) ##25	AFF4 (ENSSFOG00015018646)	uqcrq (ENSSFOG00015027428)	gdf9 (ENSSFOG00015018741) #34	ENSSFOG00015018754	ENSSFOG00015026126 #35	septin8b (ENSSFOG00015018786)	CCNI2 (ENSSFOG00015018827)	ccng1 (ENSSFOG00015024879)	nudcd2 (ENSSFOG00015032834)	GABRG2 (ENSSFOG00015000943)